Jest to aplikacja systemu Windows o nazwie Gen3D, której najnowszą wersję można pobrać jako gen3d.cpp. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Gen3D z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Gen3D
OPIS
Gen3D to aplikacja przeznaczona do określania trójwymiarowych modeli genomu i chromosomów. Wykorzystuje dane kontaktowe chromosomów do konstruowania trójwymiarowych konformacji. Ta metoda może generować trójwymiarowe modele chromosomalne spełniające dużą część kontaktów chromosomowych.
Oprogramowanie jest rozwijane w Laboratorium Bioinformatyki, Eksploracji Danych i Uczenia Maszynowego prof. Jianlina Chenga na Wydziale Informatyki Uniwersytetu Missouri - Columbia, USA. Projekt jest wspierany przez Narodową Fundację Nauki (nr grantu DBI1149224).
Jeśli używasz Gen3D w swoich badaniach, zacytuj:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao i Jianlin Cheng. „Iteracyjna rekonstrukcja trójwymiarowych modeli ludzkich chromosomów na podstawie danych kontaktowych chromosomów”. BMC bioinformatyka 16, no. 1 (2015): 338.
Korzyści
- Użyj danych kontaktowych chromosomów uzyskanych przy użyciu techniki Hi-C
- Konstruuj strukturalne modele genomu i chromosomów 3D na podstawie danych kontaktowych chromosomów
- Zainicjuj współrzędne stosując podejście probabilistyczne
- Nowatorska metoda reprezentacji zadowolonych kontaktów w macierzy mapy cieplnej
- Schematy punktacji, aby dowiedzieć się, kontakty dalekiego i krótkiego zasięgu
- W porównaniu z innymi istniejącymi metodami, a także zweryfikowano z cechami genomu
Publiczność
Nauka/Badania, Inżynieria
Język programowania
C + +
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/gen3d/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
