To aplikacja dla systemu Windows o nazwie Javamony, przeznaczona do uruchamiania w systemie Windows online przez system Linux. Jej najnowszą wersję można pobrać jako plik Javamony.jar. Można ją uruchomić online w darmowym hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Javamony, aby uruchomić ją w systemie Windows przez system Linux za darmo przy użyciu programu OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Javamony będzie działać w systemie Windows online za pośrednictwem Linuksa online
OPIS
Na podstawie niezbyt udanej Pysimony (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), ten sam zdeterminowany student ponownie podejmuje problem filogenetyczny.Javamony jest wywoływana w następujący sposób:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [losowy / krokowy (drzewo początkowe)] [liczba programów początkowych] [takson grupy obcej #1] [takson grupy obcej #2] ...
Nie pomyślany jako konkurencyjny program wnioskowania filogenetycznego, Javamony jest dla mnie okazją do przyswojenia języka Java podczas nauki rozwiązywania podstawowych problemów filogenetycznych. Dlatego dla własnej korzyści edukacyjnej cały kod jest oryginalny. Oczywiście prawdopodobnie jest też sporo błędów.
Dystrybuuję Javamony, podobnie jak Pysimony, mając nadzieję, że będzie to wartość edukacyjna dla kogoś innego lub przynajmniej nieco zabawna.
Nadchodzące funkcje to:
- Wsparcie dla sekwencji aminokwasowych
- Wsparcie dla dodatkowych formatów plików (np. Nexus)
- Wielowątkowość
- Dodatkowe metody punktacji (np. maksymalne prawdopodobieństwo)
Funkcjonalności
- Wykorzystuje maksymalną oszczędność
- Czyta plik wejściowy FASTA (tylko DNA)
- Utworzona przez użytkownika grupa zewnętrzna
- Drzewa startowe z losowym i stopniowym dodawaniem
- Wykorzystuje wyszukiwanie drzew SPR (przycinanie i przeszczepianie poddrzewa)
- Wykonuje ładowanie początkowe
- Wyprowadza standardowy format Newick z obsługą ładowania początkowego i długości gałęzi
- Rysuje ostatnie drzewo z obsługą bootstrap
Publiczność
Nauka/Badania, Edukacja
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Java
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/javamony/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
