To jest aplikacja Windows o nazwie sgRNAcas9, której najnowszą wersję można pobrać jako sgRNAcas9_3.0.5.zip. Można ją uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie sgRNAcas9 z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
sgRNAcas9
OPIS
Pakiet ten składa się z programów do wyszukiwania miejsc docelowych CRISPR (protoprzerywników) z parametrami zdefiniowanymi przez użytkownika, przewidywania potencjalnych miejsc cięcia poza docelowym Cas9 w całym genomie (POT), klasyfikacji POT do trzech kategorii, projektowania partii oligonukleotydów do konstruowania 20 -nt (nukleotydy) lub wektory ekspresyjne skróconego sgRNA, ekstrahują sekwencje nukleotydowe o pożądanej długości flankujące miejsca cięcia w miejscu docelowym lub poza nim w celu zaprojektowania par starterów PCR w celu walidacji mutacji w teście cięcia T7E1. Co ważne, poprzez identyfikację potencjalnych miejsc poza celem in silico, sgRNAcas9 umożliwia wybór bardziej specyficznych miejsc docelowych i pomaga w identyfikacji miejsc poza celem, znacznie ułatwiając projektowanie sgRNA do zastosowań związanych z edycją genomu.Cytaty: Xie S, ShenB,Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: pakiet oprogramowania do projektowania sgRNA CRISPR i oceny potencjalnych miejsc cięcia poza docelowym. PLoS Jeden. 2014,9(6):e100448.
http://www.biootools.com/
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
