To jest aplikacja Windows o nazwie TomoJ, której najnowszą wersję można pobrać jako TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie TomoJ z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
TomoJ
Ad
OPIS
TomoJ to wtyczka ImageJ do rekonstrukcji tomograficznej.
Został zaprojektowany do tomografii elektronowej, jednak każda akwizycja z wiązką równoległą powinna działać.
TomoJ proponuje wstępne przetwarzanie i rejestrację serii pochyleń przed rekonstrukcjami 3D (WBP, ART, SIRT, OS-SART, kompresja wykrywania).
TomoJ jest napisany w Javie, obliczenia są wielowątkowe, a rekonstrukcję można wykonać na CPU lub GPU (OpenCL).
rejestracja jest opisana w:
Journal of Structural Biology: X. 2020, tom 4. „Ulepszenia wyrównania obrazów bez znaczników dla tomografii elektronowej” COS Sorzano i in. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC Bioinformatyka. 2009 kwi 27;10:124. „Rejestracja obrazu bez znaczników serii pochylenia tomografii elektronowej”. COS Sorzano i in.
część rekonstrukcyjna została opisana w:
BMC Bioinformatyka. 2007 sierpnia 6; 8:288. „TomoJ: oprogramowanie tomograficzne do trójwymiarowej rekonstrukcji w transmisyjnej mikroskopii elektronowej”. Messaoudi C i in.
Korzyści
- tomografia
- ObrazJ
- Wyrównanie serii pochylenia
- rekonstrukcja 3D
- WBP
- ART
- SIRT
- skompresowane wykrywanie
Interfejs użytkownika
Huśtawka Java
Język programowania
Java, OpenCL
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/tomoj/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
