To aplikacja dla systemu Windows o nazwie Universal-mer, której najnowszą wersję można pobrać jako Universal-MerV1.0.0.zip. Można ją uruchomić online w darmowym hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom bezpłatnie aplikację Universal-mer z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Uniwersalny-mer
OPIS
Universal-Mer to narzędzie do zliczania k-merów dla wszystkich możliwych rozmiarów k jednocześnie. W porównaniu z typowymi narzędziami do zliczania k-merów, program może zsumować dokładny wynik zliczania od 1-merów do l-merów jednocześnie, gdzie l = długość najdłuższego powtarzanego podciągu w sekwencji wejściowej, gdzie maksymalna długość wynosi 100000 1-merów. Program może podać dokładną liczbę wszystkich powtarzających się (częstotliwość > 1) i unikatowych (częstotliwość = XNUMX) merów, a także liczbę wszystkich możliwych podciągów sekwencji bez odcinania merów o niskiej częstotliwości.
Pliki wejściowe mogą być w formacie tekstowym lub FAST. Alfabet wejściowy to teraz tylko {A, C, G, T}. Pliki tekstowe wejściowe będą traktowane w formacie FAST bez linii opisu. Po zliczeniu i utworzeniu bazy danych wszystkich możliwych długości k k-merów, użytkownik może wybrać z menu dowolny rozmiar k, aby zliczyć histogram, zrzucić k-mery, wykonać zapytanie o podciąg i podsumować wszystkie możliwe k.
Funkcjonalności
- Podsumuj odrębne powtarzające się i unikalne 1-mery do l-merów, gdzie l = najdłuższa długość powtórzeń
- Policz histogram k-merów, gdzie 1<=k<= długość sekwencji wejściowej
- Policz histogram kanonicznych k-merów, gdzie 1<=k<= długość sekwencji wejściowej
- Zrzut k-merów, gdzie 1<=k<= długość sekwencji wejściowej
- Zrzuć kanoniczne k-mery, gdzie 1<=k<= długość sekwencji wejściowej
- Zapytaj k-mer o dowolnym rozmiarze k, gdzie k<=200000 w sekwencjach wejściowych.
- Znajdź najdłuższy powtarzający się podciąg sekwencji wejściowej.
Interfejs użytkownika
Konsola/Terminal, wiersz poleceń
Język programowania
C
Kategorie
Tę aplikację można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/universal-mer/. Została ona umieszczona w OnWorks, aby można ją było uruchomić online w najłatwiejszy sposób z jednego z naszych darmowych systemów operacyjnych.
