Este é o comando cassiopee que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
cassiopee - página de manual para Cassiopee Versão 1.0
SINOPSE
cassiope [Opções]
DESCRIÇÃO
Uso:
-l: profundidade máxima do índice / tamanho máximo do padrão
-u: salvar índice para uso posterior
-s: sequência para indexar
-p: padrão para pesquisar
-f: arquivo contendo padrão para pesquisar
-o: arquivo de saída
-r: aplicar redução de árvore
-m: modo de pesquisa: 0 = DNA, 1 = RNA, 2 = Proteína
-a: permitir pesquisa de ambiguidade do alfabeto
-n: máximo de N correspondências consecutivas permitidas na pesquisa
-e: correspondência máxima permitida na pesquisa
-i: max indel permitidas correspondências na pesquisa
-g: gera um arquivo de ponto do gráfico
-d: profundidade máxima do gráfico
-t: formato de saída: 0: tsv (padrão), 1: json
-x: posição mínima na sequência
-y: posição máxima na sequência
-v: mostrar a versão
-h: mostrar esta mensagem
Use cassiopee online usando serviços onworks.net
