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cmtk-imagemath - Online na nuvem

Execute cmtk-imagemath no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando cmtk-imagemath que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS

PROGRAMA:

NOME


imagemath - Operações de imagem

DESCRIÇÃO


Execute operações em imagens usando notação postfix baseada em pilha.

As imagens podem ser lidas de arquivos e colocadas na pilha. As imagens na pilha podem ser
processados ​​e combinados por meio de diferentes operadores. Os resultados de todas as operações são devolvidos
na pilha, onde podem ser processados ​​posteriormente ou gravados de volta em arquivos de imagem.

OPÇÕES


Global Kit de ferramentas Opções (estes e guarante que os mesmos estão compartilhado by todos os CMTK Ferramentas)
--Socorro
Grave uma lista de opções básicas de linha de comando na saída padrão.

--ajuda-tudo
Escreva uma lista completa de opções de linha de comando básicas e avançadas na saída padrão.

--wiki
Escreva uma lista de opções de linha de comando para a saída padrão na marcação MediaWiki.

--cara
Grave o código-fonte da página de manual na marcação 'nroff' para a saída padrão.

--versão
Grave a versão do kit de ferramentas na saída padrão.

--eco
Grave a linha de comando atual na saída padrão.

--nível detalhado
Defina o nível de verbosidade.

--verbose, -v
Aumentar o nível de detalhamento em 1 (obsoleto; com suporte para compatibilidade com versões anteriores).

--tópicos
Defina o número máximo de threads paralelos (para threads POSIX e OpenMP).

Input / output operações
--no
Leia a (s) imagem (ns) de entrada para o topo da pilha

--Fora
Grave a imagem de saída do topo da pilha (mas deixe-a na pilha)

--set-padding-valor
Defina o valor que é interpretado como valor de preenchimento nas imagens lidas subsequentemente.

--unset-preenchimento
Desative o preenchimento. Todos os valores em imagens lidas subsequentemente serão interpretados como reais
dados.

Interno Configurações
--flutuador
Use precisão única para cálculos e resultados [Este is que o predefinição]

--Duplo
Use precisão dupla para cálculos e resultados

Pilha operações
- pop
Retirar (descartar) a imagem superior da pilha.

--dup
Imagem duplicada no topo da pilha.

--tudo
Aplique a próxima operação de imagem única a todas as imagens da pilha.

Imagem única operadores
--preencher
Preencha a imagem superior com um valor constante (ou seja, atribua valor a todos os pixels)

--abdômen
Aplicar a função abs () à imagem superior

--registro
Aplicar função log () à imagem superior

--logit
Aplicar a função log (x / (1-x)) à imagem superior

--logística
Aplicar função 1 / (1 + exp (-x)) à imagem superior

--exp
Aplicar a função exp () à imagem superior

--sqr
Aplicar operador quadrado à imagem superior

--sqrt
Aplicar operador de raiz quadrada à imagem superior

--trunc
Truncar todos os valores na imagem superior para um inteiro

- uma vez
Para cada pixel, substitua seu valor x por 1.0 / x

--escalar-mul
Multiplique a imagem superior por um valor escalar

--scalar-adicionar
Adicione um escalar a cada pixel da imagem superior

--escalar-xor
Exclusivo bit a bit - ou entre o nível superior e o valor escalar fornecido

--scalar- e
Bitwise e operação entre o nível superior e o valor escalar fornecido

--thresh-abaixo
Defina os valores abaixo do limite determinado para o limite.

--thresh-acima
Defina os valores acima do limite determinado para o limite.

Imagem par operadores
--adicionar
Adicione a imagem superior e a segunda, coloque o resultado na pilha

--mul
Multiplique a imagem superior e a segunda, coloque o resultado na pilha

--div
Divida a imagem superior pela segunda imagem, coloque o resultado na pilha

--atan2
Calcule a função atan2 () a partir de dois pares de pixels de imagem, coloque o resultado na pilha

--match-histogramas
Escale as intensidades em uma imagem para coincidir com as intensidades de outra. A última imagem enviada
na pilha fornece a distribuição de intensidade de referência, a imagem anterior
será modificado. Ambas as imagens de entrada são removidas da pilha e a imagem modificada
é colocado na pilha.

--match-mean-sdev
Escale as intensidades de uma imagem para coincidir com a média e o desvio padrão de outra. o
última imagem colocada na pilha fornece a distribuição de intensidade de referência, o
a imagem anterior será modificada. Ambas as imagens de entrada são removidas da pilha e
a imagem modificada é colocada na pilha.

--match-mean-sdev3
Intensidades de escala de uma imagem por um fator e deslocamento calculado a partir de duas outras imagens
para combinar seus desvios médios e padrões. A última imagem colocada na pilha
fornece a distribuição de intensidade de referência, a imagem anterior fornece a
distribuição de intensidade para coincidir com a imagem de referência, e a terceira imagem no
pilha será modificada. Todas as três imagens de entrada são removidas da pilha e o
a imagem modificada é colocada na pilha.

--mask-média
Média da máscara: a imagem superior é considerada uma máscara com vários rótulos. Os pixels no
a segunda imagem é calculada por rótulos de máscara e, em seguida, substituída pelo valor médio
para cada etiqueta de máscara.

Complexo Aritmética
--complexo-div
Divisão complexa, (a + ib) / (c + id), assumindo que quatro valores foram colocados na pilha em ordem
a, b, c, d. Coloque o resultado na pilha, real primeiro, imaginário em segundo lugar (ou seja, o imaginário é
principal).

Operadores que contract que o todo pilha para dentro a solteiro imagem
--soma
Some todas as imagens na pilha, coloque o resultado na pilha

--produtos
Calcule o produto de todas as imagens na pilha, coloque o resultado na pilha

--média
Calcule a média de todas as imagens na pilha, coloque o resultado na pilha

--variância
Para cada pixel, calcule a variação de todas as imagens na pilha, coloque o resultado na pilha

--combine-pca
Combine imagens usando PCA projetando na direção de maior correlação

--Valor máximo
Para cada pixel, calcule o valor máximo de VALUE em todas as imagens, coloque o resultado na pilha

--valor-mín.
Para cada pixel, calcule VALUE mínimo sobre todas as imagens, coloque o resultado na pilha

--índice máximo
Para cada pixel, calcule INDEX da imagem com o valor máximo, coloque o resultado na pilha

Operadores que contract a pilha of rótulo imagens para dentro a solteiro rótulo imagem
--voto
Junte todas as imagens na pilha com a votação, coloque o resultado na pilha

--grampo
Combine mapas binários na pilha usando iterações [arg] do algoritmo STAPLE. o
resultado desta operação é o mapa espacial de 'pesos' W, que são os
probabilidades de primeiro plano da imagem em cada pixel. No modo 'detalhado', especialista estimado
os parâmetros p (sensibilidade) eq (especificidade) também são gravados na saída padrão.

--rótulos de contrato
Contraia vários mapas de etiquetas em um, selecionando o primeiro (sobre todas as imagens no
pilha) rótulo diferente de zero em cada pixel

--mstaple
Combine mapas multi-rótulo na pilha usando iterações [arg] da multi-classe
Algoritmo STAPLE. O resultado desta operação é a probabilidade máxima combinada
mapa multi-rótulo.

--mstaple-disputado
Como a operação anterior, aplique o algoritmo STAPLE multiclasse, mas restrinja a computação
para voxels 'disputados', ou seja, aqueles em que os mapas do rótulo de entrada discordam. Isso frequentemente
melhora os resultados reduzindo, por exemplo, os efeitos de fundo.

--stack-entropia-rótulos
Calcula a entropia da pilha em cada pixel a partir de imagens de entrada de inteiros (rótulo)

AUTORES


Torsten Rohlfing, com contribuições de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Use cmtk-imagemath online usando serviços onworks.net


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