cmtk-unwarp_image_phantom - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

unwarp_image_phantom - Criar transformação para desfazer a distorção de uma imagem com base em um fantasma
descrição

SINOPSE

unwarp_image_phantom EntradaPhantom EntradaImagem SaídaXform

DESCRIÇÃO

Esta ferramenta calcula uma transformação polinomial ou deformação de forma livre B-spline para
retire a distorção de uma imagem. A transformação é baseada em marcos esperados e detectados em um
imagem de um fantoma estrutural adquirida no mesmo scanner. Use o 'detect_adni_phantom'
ferramenta para detectar pontos de referência do Phantom ADNI em uma imagem e gerar um fantasma
arquivo de descrição adequado para uso com esta ferramenta.

OPÇÕES

Global Kit de ferramentas Opções (estes e guarante que os mesmos estão compartilhado by todos os CMTK Ferramentas)
--Socorro
Grave uma lista de opções básicas de linha de comando na saída padrão.

--ajuda-tudo
Escreva uma lista completa de opções de linha de comando básicas e avançadas na saída padrão.

--wiki
Escreva uma lista de opções de linha de comando para a saída padrão na marcação MediaWiki.

--cara
Grave o código-fonte da página de manual na marcação 'nroff' para a saída padrão.

--versão
Grave a versão do kit de ferramentas na saída padrão.

--eco
Grave a linha de comando atual na saída padrão.

--nível detalhado
Defina o nível de verbosidade.

--verbose, -v
Aumentar o nível de detalhamento em 1 (obsoleto; com suporte para compatibilidade com versões anteriores).

--tópicos
Defina o número máximo de threads paralelos (para threads POSIX e OpenMP).

Apropriado Opções
--fit-inverso
Transformação inversa de ajuste (mapeamento de locais de pontos de referência reais para os esperados). Isto é
útil para calcular um mapa de correção de volume Jacobiano (usando 'reformatx') sem
tendo que inverter numericamente a transformação sem distorção ajustada.

- fit-forward
Transformação de ajuste para a frente (mapeamento esperado para locais de pontos de referência reais). Isto é
útil para retificar a imagem por meio de redefinição (usando 'reformatx'). [Este is que o
predefinição]

Transformação Modelos
--spline
Ajuste de deformação de forma livre B-spline.

--poli
Transformação polinomial de ajuste. [Este is que o predefinição]

Polinomial Apropriado Opções (com --poli)
--grau
Grau da transformação polinomial ajustada. [Predefinição: 4]

B-Splines Apropriado Opções (com --spline)
--final-cp-espaçamento
Espaçamento final da grade do ponto de controle da transformação B-spline de saída. [Predefinição: 0]

--final-cp-dims
Dimensões da grade do ponto de controle final (ou seja, número de pontos de controle) da saída B-
transformação de spline. Para ser fornecido como 'dimX, dimY, dimZ'. [Predefinição: NENHUM]

- níveis
Número de níveis no procedimento de aproximação B-spline multinível. [Predefinição: 1]

--iterações por nível
Número máximo de iterações de atualização do coeficiente de spline por nível no multi-nível
Procedimento de aproximação de B-spline. [Predefinição: 100]

--limite rms
Limiar para melhoria relativa do resíduo de ajuste RMS. A iteração de ajuste
termina se (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate) / rmsBeforeUpdate <limite.
[Predefinição: 0]

--no-fit-ffine
Desative o ajuste da transformação afim para inicializar o spline. Em vez disso, ajuste a ranhura
diretamente. Isso geralmente dá resultados piores e é desencorajado.

AUTORES

Torsten Rohlfing, com contribuições de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Use cmtk-unwarp_image_phantom online usando serviços onworks.net