Este é o comando delta2blocks que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
delta2blocks - ferramenta extra para mummer de patch of mugsy para classificar alinhamentos
delta2maf - ferramenta extra para mummer de patch of mugsy para classificar alinhamentos
SINOPSE
blocos delta2 [opções]<refID><qryID>
delta2maf [opções]<refID><qryID>
DESCRIÇÃO
-h Exibir informações de ajuda
-q Classifique os alinhamentos pela coordenada de início da consulta
-r Classifique os alinhamentos pela coordenada inicial de referência
-w int Defina a largura da tela - o padrão é 60
-x int Defina o tipo de matriz - o padrão é 2 (BLOSUM 62), outras opções incluem 1 (BLOSUM 45)
e 3 (BLOSUM 80)
nota: só tem efeito nos alinhamentos de aminoácidos
A entrada é a saída .delta do programa "nucmer" ou "promer" passado no
linha de comando.
A saída é para stdout e consiste em todos os alinhamentos entre a consulta e a referência
sequências identificadas na linha de comando.
NOTA: Nenhuma classificação é feita por padrão, portanto, os alinhamentos serão ordenados como encontrados em
a entrada.
Use delta2blocks online usando serviços onworks.net
