Este é o comando EDTSurf que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador Windows online ou emulador MAC OS online
PROGRAMA:
NOME
EDTSurf - construção rápida e precisa de superfícies macromoleculares
SINOPSE
EDT Surf -i pdbname...
DESCRIÇÃO
EDTSurf é um programa de código aberto para construir superfícies trianguladas para macromoléculas. Isto
gera três superfícies macromoleculares principais: superfície de van der Waals, acessível a solvente
superfície e superfície molecular (superfície sem solvente). EDTsurf também identifica cavidades
que estão dentro de macromoléculas.
OPÇÕES
-o nome externo
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c Cadeia de 1 átomos de 2 átomos de 3 puro
-p raio da sonda [0,2.0]
-f fator de escala (0,20.0]
-h 1 entrada e saída 2 saídas 3 entradas
saída1: outname.ply
saída2: nome externo.asa
saída3: outname-cav.pdb
Use EDTSurf online usando serviços onworks.net
