Este é o comando fastaq-to_fasta que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fastaq_to_fasta - Converte uma variedade de formatos de entrada para o formato FASTA bem formatado
DESCRIÇÃO
uso: fastaq_to_fasta [opções]
Converte uma variedade de formatos de entrada em um formato FASTA bem formatado
posicional argumentos:
infile Nome do arquivo de entrada. Pode ser qualquer um de FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
arquivo de saída
Nome do arquivo de saída
opcional argumentos:
-h, --Socorro
mostre esta mensagem de ajuda e saia
-l COMPRIMENTO DA LINHA, --comprimento da linha COMPRIMENTO DA LINHA
Número de bases em cada linha de sequência do arquivo de saída. Definido como zero para não
quebras de linha em sequências [60]
-s, --strip_after_whitespace
Remova tudo após o primeiro espaço em branco em cada nome de sequência
-u, --check_unique
Morrer se algum dos nomes de sequência de saída não for exclusivo
Use fastaq-to_fasta online usando serviços onworks.net