Este é o comando fastaq-trim_contigs que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fastaq_trim_contigs - corta um determinado número de bases no final de cada contig
DESCRIÇÃO
uso: fastaq_trim_contigs [opções]
Elimina um determinado número de bases do final de cada contig, então as lacunas ficam maiores e contig
extremidades são removidas. As bases são substituídas por Ns. Qualquer sequência que termina como todos os Ns é perdida
posicional argumentos:
infile Nome do arquivo de entrada
arquivo de saída
Nome do arquivo de saída
opcional argumentos:
-h, --Socorro
mostre esta mensagem de ajuda e saia
--trim_número TRIM_NUMBER
Número de bases para aparar em torno de cada lacuna e fora das extremidades de cada sequência [100]
Use fastaq-trim_contigs online usando serviços onworks.net
