fdk - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

fdk - reconstrução de feixe cônico de projeções usando o algoritmo FDK

O termo FDK refere-se aos autores Feldkamp, ​​Davis e Kress que escreveram o artigo seminal
"Algoritmo prático de feixe cônico" em 1984. Seu artigo descreve uma projeção traseira filtrada
algoritmo de reconstrução para geometrias de feixe cônico. O programa fdk em plastimatch é um
implementação do algoritmo FDK.

FDK USO

O programa fdk pega um diretório de imagens de projeção 2D como entrada e gera um único
Volume 3D como saída.

O uso da linha de comando é:

Uso: fdk [opções]
opções:
-A hardware "cpu" ou "cuda" (padrão = cpu)
-a "num ((num) num)" Use este intervalo de imagens
-r "r1 r2 r3" Definir resolução de saída (em voxels)
-f filter "nenhum" ou "rampa" (padrão = rampa)
-s scale Escala a intensidade do arquivo de saída
-z "s1 s2 s3" Tamanho físico da reconstrução (em mm)
-I indir O diretório de entrada
-O outfile O arquivo de saída

O uso do programa fdk é melhor compreendido seguindo os tutoriais:
fdk_tutorial_i e fdk_tutorial_ii.

INPUT ARQUIVOS

Três formatos diferentes de arquivos de entrada são suportados. Estes são:

· Arquivos de imagem de formato Pfm com arquivos txt geomtry

· Arquivos de imagem de formato bruto com arquivos txt geomtry

· Arquivos Varian hnd

Os arquivos pfm e raw são semelhantes, pois armazenam a imagem como um array de 4 bytes
flutuadores little-endian. A única diferença é que o arquivo pfm tem um cabeçalho que armazena
o tamanho da imagem, e o arquivo raw não.

Cada pfm ou arquivo de imagem bruta deve ter um arquivo de geometria no mesmo diretório com o .txt
extensão. Por exemplo, se você deseja usar image_0000.pfm em uma reconstrução, você deve
forneça outro arquivo image_0000.txt que contém a geometria. Uma breve descrição de
o formato do arquivo de geometria é dado em formato_proj_mat_file_format.

A sequência de arquivos deve ser armazenada com o padrão:
XXXXAAAA.ZZZ

onde XXXX é um prefixo, YYYY é um número e .ZZZ é a extensão de um tipo conhecido
(.hnd, .pfm ou .raw).

Por exemplo, o seguinte seria um bom layout de diretório para arquivos pfm:

Files / image_00.pfm
Files / image_00.txt
Files / image_01.pfm
Files / image_01.txt
etc ...

Os arquivos Varian hnd devem ser armazenados no layout original. Por exemplo:

Files / ProjectionInfo.xml
Files / Scan0 / Proj_0000.hnd
Files / Scan0 / Proj_0001.hnd
etc ...

Nenhum arquivo txt de geometria é necessário para reconstruir a partir do formato Varian hnd.

IMAGEM GEOMETRIA

Por padrão, quando você gera um DRR, a imagem é orientada como se a fonte de raio-x virtual
eram uma câmera. Isso significa que para um filme lateral direito, as colunas da imagem vão de
inf para sup, e as fileiras vão de formiga a poste. O sistema Varian OBI produz arquivos HND,
que são orientados de forma diferente. Para um filme lateral direito, as colunas das imagens HND vão
de formiga a poste, e as fileiras vão de sup para inf. Uma ilustração dessa ideia é mostrada
na figura abaixo.
[imagem] Geometria dos arquivos Varian HND.UNINDENT

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