Este é o comando fix-trinity-output que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fix-trinity-output - Corrige arquivos fastq de saída do Trinity
DESCRIÇÃO
Trinity gera arquivos fastq que foram 'corrigidos'
Infelizmente, esses arquivos não estão mais emparelhados corretamente e, portanto, não podem ser usados em
a maioria dos alinhadores, como bowtie2 e snap
Este script tenta consertar isso e produzir 2 arquivos fastq emparelhados corretamente e um fastq
arquivo contendo leituras únicas
OPÇÕES
--deixou, -l :
arquivo fastq de leituras à esquerda
--direito, -r :
arquivo fastq de leituras corretas
--resultado, -o :
prefixo de saída
--Socorro, -h:
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