Este é o comando fuzztrane que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fuzztran - Pesquisa de padrões em sequências de proteínas (traduzido)
SINOPSE
fuzztran -seqüência sequência -padronizar de cinto de segurança [-quadro, Armação Lista] [-mesa Lista] -arquivo de saída Denunciar
fuzztran -Socorro
DESCRIÇÃO
fuzztran é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Nucleico: Motivos, Proteína: Motivos".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüência sequência
-padronizar de cinto de segurança
São usados os códigos padrão de uma letra IUPAC para os aminoácidos. O símbolo 'x' é
usado para uma posição onde qualquer aminoácido é aceito. Ambiguidades são indicadas por
listando os aminoácidos aceitáveis para uma determinada posição, entre parênteses quadrados '[
] '. Por exemplo: [ALT] significa Ala ou Leu ou Thr. Ambiguidades também são indicadas por
listar entre um par de chaves '{}' os aminoácidos que não são aceitos
em uma posição gven. Por exemplo: {AM} significa qualquer aminoácido, exceto Ala e Met.
Cada elemento em um padrão é separado de seu vizinho por um '-'. (Opcional em
fuzztran) A repetição de um elemento do padrão pode ser indicada seguindo aquele
elemento com um valor numérico ou um intervalo numérico entre parênteses. Exemplos:
x(3) corresponde a xxx, x (2,4) corresponde a xx ou xxx ou xxxx. Quando um
padrão é restrito ao terminal N ou C de uma sequência, esse padrão
ou começa com um símbolo '<' ou, respectivamente, termina com um símbolo '>'. Um período termina
o padrão. (Opcional no fuzztran). Por exemplo, [DE] (2) HS {P}X(2) PX (2,4) C
Adicional seção
-quadro, Armação Lista
Valor padrão: 1
-mesa Lista
saída seção
-arquivo de saída Denunciar
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