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fuzztrane - Online na nuvem

Execute o fuzztrane no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando fuzztrane que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

PROGRAMA:

NOME


fuzztran - Pesquisa de padrões em sequências de proteínas (traduzido)

SINOPSE


fuzztran -seqüência seqall -padronizar de cinto de segurança [-quadro, Armação Lista] [-mesa Lista] -arquivo de saída Denunciar

fuzztran -Socorro

DESCRIÇÃO


fuzztran é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Nucleico: Motivos, Proteína: Motivos".

OPÇÕES


Entrada seção
-seqüência seqall

-padronizar de cinto de segurança
São usados ​​os códigos padrão de uma letra IUPAC para os aminoácidos. O símbolo 'x' é
usado para uma posição onde qualquer aminoácido é aceito. Ambiguidades são indicadas por
listando os aminoácidos aceitáveis ​​para uma determinada posição, entre parênteses quadrados '[
] '. Por exemplo: [ALT] significa Ala ou Leu ou Thr. Ambiguidades também são indicadas por
listar entre um par de chaves '{}' os aminoácidos que não são aceitos
em uma posição gven. Por exemplo: {AM} significa qualquer aminoácido, exceto Ala e Met.
Cada elemento em um padrão é separado de seu vizinho por um '-'. (Opcional em
fuzztran) A repetição de um elemento do padrão pode ser indicada seguindo aquele
elemento com um valor numérico ou um intervalo numérico entre parênteses. Exemplos:
x(3) corresponde a xxx, x (2,4) corresponde a xx ou xxx ou xxxx. Quando um
padrão é restrito ao terminal N ou C de uma sequência, esse padrão
ou começa com um símbolo '<' ou, respectivamente, termina com um símbolo '>'. Um período termina
o padrão. (Opcional no fuzztran). Por exemplo, [DE] (2) HS {P}X(2) PX (2,4) C

Adicional seção
-quadro, Armação Lista
Valor padrão: 1

-mesa Lista

saída seção
-arquivo de saída Denunciar

Use fuzztrane online usando serviços onworks.net


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