gdcmraw - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

gdcmraw - Extrair campo de valor do elemento de dados.

SINOPSE

gdcmraw [opções] arquivo de entrada de arquivo de saída

DESCRIÇÃO

O gdcmraw ferramenta é usada principalmente para fins de desenvolvimento. É usado para extrair um específico
campo binário de um DataSet DICOM.

PARÂMETROS

arquivo no arquivo de entrada DICOM

nome do arquivo de saída de saída

OPÇÕES

-i --input Nome do arquivo de entrada
-o --output Nome do arquivo de saída
-t --tag Especifica a tag da qual extrair o valor.

ESPECÍFICO OPÇÕES

-S --split-frags Divide fragmentos em vários arquivos.
-p --pattern Especifique o padrão de arquivo final (veja split-frags).
-P --pixel-data Dados de pixel à direita de 0.

SUPORTE OPÇÕES

-h --ajuda
imprima este texto de ajuda e saia

-v --versão
imprimir informações da versão e sair

-V --verboso
modo detalhado (aviso + erro).

-W - advertência
modo de aviso, imprimir informações de aviso

-E --erro
modo de erro, imprimir informações de erro

-D --depurar
modo de depuração, imprimir informações de depuração

TÍPICA USO

Copiar Atributo Valor para lima
Isso extrairá o valor no Tag (0025,101b):

$ gdcmraw -i GE_MR_0025xx1bProtocolDataBlock.dcm -t 25,101b -o pdb.raw

Extrair pixels Dados
Se você não especificar nenhuma tag, o elemento Pixel Data será o padrão. Então por exemplo
para obter os dados de pixel de uma imagem:

$ gdcmraw -i teste.acr -o teste.raw

Você pode então, por exemplo, calcular o md5sum desses dados de pixel (muito útil):

$ md5sum teste.raw
f845c8f283d39a0204c325654493ba53 test.raw

Encapsulado Sintaxe
Quando os dados de pixel são encapsulados, vários fragmentos podem ser usados ​​para armazenar um único
imagem de fatia:

$ gdcmdump D_CLUNIE_CT1_J2KR.dcm

\ & ...
(7fe0,0010) OB # u / l, dados de 1 pixel
(fffe, e000) ?? [] # 0,1 Item
(fffe,e000) ?? ff\\4f\\ff\\51\\00\\29\\00\\00\\00\\00\\02\\00\\00\\00\\02\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\00\\02\\00\\00\\00\\02\\00 # 65536,1 Item
(fffe,e000) ?? 2c\\b7\\ee\\68\\de\\e3\\93\\2d\\b3\\b8\\ba\\90\\7b\\42\\3e\\f8\\42\\16\\64\\88\\46\\30\\37\\d4\\50\\95\\9b\\b6\\a5\\c7\\38\\9b # 65536,1 Item
(fffe,e000) ?? 48\\3c\\03\\e8\\c4\\3f\\44\\e1\\8a\\5c\\73\\3b\\02\\0a\\ad\\a5\\8f\\e4\\0c\\81\\76\\a2\\d7\\1b\\7f\\b7\\cd\\bc\\30\\c6\\6a\\6a # 43308,1 Item
(fffe, e0dd) 0

Para criar uma imagem J2K a partir dele, precisamos extrair cada fragmento e
concatená-los:

$ gdcmraw -i D_CLUNIE_CT1_J2KR.dcm -o D_CLUNIE_CT1_J2KR.j2k

Este é um arquivo J2K válido, usando o pacote de software Kakadu:

$ kdu_expand -i D_CLUNIE_CT1_J2KR.j2k -o D_CLUNIE_CT1_J2KR.tiff -registro D_CLUNIE_CT1_J2KR.txt

$ gato D_CLUNIE_CT1_J2KR.txt

Sprofile = PROFILE2
Scap = não
Sextensões = 0
Tamanho = {512,512}
Sorigin = {0,0}
Stiles = {512,512}
Stile_origin = {0,0}
Scomponentes = 1
Sinalizado = sim
Sprecision = 16
Amostragem S = {1,1}
Sdims = {512,512}
Cycc = no
Cmct = 0
Clayers = 1
Cuse_sop = não
Cuse_eph = no
Corder = LRCP
Calign_blk_last = {não, não}
Manilhas = 5
Cads = 0
Cdfs = 0
Cdecomp = B (-: - :-)
Creversível = sim
Ckernels = W5X3
Catk = 0
Cuse_precincts = no
Cblk = {64,64}
Cmodes = 0
Qguard = 1
Qabs_ranges = 18,19,19,20,19,19,20,19,19,20,19,19,20,19,19,20

>> Novos atributos para o bloco 0:

Extrair fragmentos as solteiro lima
Às vezes, cada fragmento é, na verdade, uma única fatia, então não precisaríamos concatenar
eles:

$ gdcmdump00191113.dcm

\ & ...
(7fe0,0010) OB # u / l, dados de 1 pixel
(fffe,e000) ?? 00\\00\\00\\00\\6b\\38\\01\\00\\10\\77\\02\\00\\37\\b6\\03\\00\\a7\\f4\\04\\00 # 20,1 Item
(fffe,e000) ?? ff\\d8\\ff\\c3\\00\\0b\\08\\02\\00\\02\\00\\01\\00\\11\\00\\ff\\c4\\00\\1b\\00\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\00\\00\\00\\00 # 79970,1 Item
(fffe,e000) ?? ff\\d8\\ff\\c3\\00\\0b\\08\\02\\00\\02\\00\\01\\00\\11\\00\\ff\\c4\\00\\1b\\00\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\00\\00\\00\\00 # 81564,1 Item
(fffe,e000) ?? ff\\d8\\ff\\c3\\00\\0b\\08\\02\\00\\02\\00\\01\\00\\11\\00\\ff\\c4\\00\\1b\\00\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\00\\00\\00\\00 # 81694,1 Item
(fffe,e000) ?? ff\\d8\\ff\\c3\\00\\0b\\08\\02\\00\\02\\00\\01\\00\\11\\00\\ff\\c4\\00\\1b\\00\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\01\\00\\00\\00\\00 # 81511 (81512),1 Item
(fffe, e0dd) 0

Vamos tentar extrair esses 4 jpeg sem perdas individuais individualmente:

$ gdcmraw --split-frags -i 00191113.dcm -o jpeg --pattern% 02d.ljpeg

Isso produzirá 4 arquivos:

-rw-r - r-- 1 mathieu mathieu 81512 2008-08-08 22:10 jpeg03.ljpeg
-rw-r - r-- 1 mathieu mathieu 81694 2008-08-08 22:10 jpeg02.ljpeg
-rw-r - r-- 1 mathieu mathieu 81564 2008-08-08 22:10 jpeg01.ljpeg
-rw-r - r-- 1 mathieu mathieu 79970 2008-08-08 22:10 jpeg00.ljpeg

NOTA DE RODAPÉ SOBRE NÓS JPEG ARQUIVOS

É um mal-entendido comum intercambiar 'JPEG 8bits com perdas' por simplesmente arquivo JPEG.
A especificação JPEG é muito mais ampla do que simplesmente o arquivo 8bits comum com perdas (como encontrado
na internet).

Você pode ter:

· JPEG com perda de 8 bits

· JPEG com perda de 12 bits

· JPEG sem perdas 2-16 bits

Isso é o que está definido em ITU-T T.81, ISO / IEC IS 10918-1.

Use gdcmraw online usando serviços onworks.net