h5dump - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

h5dump - Exibe o conteúdo do arquivo HDF5.

SINOPSE

arquivo h5dump [OPÇÕES]

DESCRIÇÃO

h5dump permite que o usuário examine o conteúdo de um arquivo HDF5 e despeje esse conteúdo,
em formato legível por humanos, para um arquivo ASCII.

h5dump despeja o conteúdo do arquivo HDF5 para a saída padrão. Ele pode exibir o conteúdo do
arquivo HDF5 inteiro ou objetos selecionados, que podem ser grupos, conjuntos de dados, um subconjunto de um
conjunto de dados, links, atributos ou tipos de dados.

A opção --header exibe apenas as informações do cabeçalho do objeto.

Os nomes são os nomes absolutos dos objetos. h5dump exibe objetos na mesma ordem que
a ordem de comando. Se um nome não começar com uma barra, o h5dump começa a procurar pelo
objeto especificado começando no grupo raiz.

Se um objeto estiver vinculado a vários nomes, o h5dump exibe o conteúdo do objeto
na primeira ocorrência. Apenas as informações do link são exibidas em ocorrências posteriores.

h5dump atribui um nome para qualquer tipo de dados não nomeado na forma de # oid1: oid2, onde oid1 e
oid2 são os identificadores de objeto atribuídos pela biblioteca. Os tipos sem nome são exibidos
dentro do grupo raiz.

Os tipos de dados são exibidos com nomes de tipo padrão. Por exemplo, se um conjunto de dados for criado
com o tipo H5T_NATIVE_INT e o nome do tipo padrão para inteiro nessa máquina é
H5T_STD_I32BE, h5dump exibe H5T_STD_I32BE como o tipo do conjunto de dados.

h5dump também pode despejar um subconjunto de um conjunto de dados. Este recurso funciona da mesma maneira que
hiperslabs em HDF5; os parâmetros especificados na linha commnd são passados ​​para a função
H5Sselect_hyperslab e a seleção resultante é exibida.

A saída do h5dump é descrita em detalhes no DDL para HDF5, a descrição de dados
Documento de idioma.

Nota: Não é permitido especificar vários atributos, conjuntos de dados, tipos de dados, grupos,
ou soft links com uma bandeira. Por exemplo, não se pode emitir o comando
ERRADO: h5dump -a / attr1 / attr2 foo.h5
para exibir / attr1 e / attr2. Deve-se emitir o seguinte comando:
CORRETO: h5dump -a / attr1 -a / attr2 foo.h5

É possível selecionar o driver de arquivo com o qual deseja abrir o arquivo HDF5 usando o
Opção de linha de comando --filedriver (-f). Os valores aceitáveis ​​para a opção --filedriver são:
"sec2", "family", "split", "multi" e "stream". Se o sinalizador do driver do arquivo não for especificado,
então o arquivo será aberto com cada driver por vez e na ordem especificada acima
até que um driver consiga abrir o arquivo.

XML SAÍDA

Com a opção --xml, h5dump gera saída XML. Esta saída contém um completo
descrição do arquivo, marcado em XML. O XML está em conformidade com o tipo de documento HDF5
Definição (DTD) disponível em http://hdf.ncsa.uiuc.edu/DTDs/HDF5-File.dtd.

A saída XML é adequada para uso com outras ferramentas, incluindo HDF5 Java Tools.

OPÇÕES

-h or --Socorro Imprima uma mensagem de uso e saia.

-B or --bloqueio de inicialização Imprima o conteúdo do bloco de inicialização. (Esta opção ainda não é
implementado.)

-H or --cabeçalho Imprima apenas o cabeçalho; nenhum dado é exibido.

-A Imprime o cabeçalho e o valor dos atributos; os dados dos conjuntos de dados não são exibidos.

-i or --object-ids Imprima os ids dos objetos.

-r or --fragmento Imprime conjuntos de dados inteiros de 1 byte como ASCII.

-V or --versão Imprime o número da versão e sai.

-a P or --attribute = P Imprime o atributo especificado.

-d P or --dataset = P Imprima o conjunto de dados especificado.

-f D or --filedriver = D Especifique com qual driver abrir o arquivo.

-g P or --group = P Imprime o grupo especificado e todos os membros.

-l P or --soft-link = P Imprima o (s) valor (es) do link simbólico especificado.

-o F or --output = F Saída de dados brutos para o arquivo F.

-t T or --datatype = T Imprime o tipo de dados nomeado especificado.

-w N or --width = N Defina o número de colunas de saída.

-x or --xml Saída XML usando esquema XML (padrão) em vez de DDL.

-u or --use-dtd Saída XML usando XML DTD em vez de DDL.

-D U or --xml-dtd = U Na saída XML, consulte o DTD ou esquema em U em vez do
esquema / DTD padrão.

-X S or --xml-dns = S Na saída XML, (Esquema XML) use nomes qualificados no XML: ":": não
namespace, padrão: "hdf5:"

-s L or --start = L Compensação do início da seleção de subconjuntos. Padrão: o início do
conjunto de dados.

-S L or --stride = L Hyperslab stride. Padrão: 1 em todas as dimensões.

-c L or --count = L Número de blocos a serem incluídos na seleção.

-k L or --block = L Tamanho do bloco no hiperslab. Padrão: 1 em todas as dimensões.

-- Indique que todos os argumentos a seguir não são opções. Por exemplo, para despejar um arquivo chamado
`-f ', use h5dump - -f.

lima O arquivo a ser examinado.

Os parâmetros de opção listados acima são definidos da seguinte forma:

D qual driver de arquivo usar ao abrir o arquivo. Os valores aceitáveis ​​são "sec2",
"family", "split", "multi" e "stream". Sem o driver de arquivo, sinalize o arquivo
será aberto com cada driver por vez e na ordem especificada acima até um
o driver consegue abrir o arquivo.

P O caminho completo do grupo raiz até o objeto

T O nome do tipo de dados

F Um nome de arquivo

N Um número inteiro maior que 1

L Uma lista de inteiros, cujo número é igual ao número de dimensões no
espaço de dados sendo consultado

U Um URI (conforme definido na [IETF RFC 2396], atualizado pela [IETF RFC 2732]) que se refere a
o DTD a ser usado para validar o XML

Parâmetros de subconjuntos também podem ser expressos em uma forma compacta conveniente, como segue:
--dataset = "/ foo / mydataset [START; STRIDE; COUNT; BLOCK]"

Todos os pontos-e-vírgulas (;) são obrigatórios, mesmo quando um valor de parâmetro não é especificado. Quando
não especificado, os valores de parâmetro padrão são usados.

EXEMPLOS

1. Descarregando o grupo / GroupFoo / GroupBar no arquivo quux.h5:
h5dump -g / GroupFoo / GroupBar quux.h5

2. Descarregando o conjunto de dados Fnord no grupo / GroupFoo / GroupBar no arquivo quux.h5:
h5dump -d / GroupFoo / GroupBar / Fnord quux.h5

3. Despejar os metadados de atributo do conjunto de dados Fnord que está no grupo
/ GroupFoo / GroupBar no arquivo quux.h5:
h5dump -a / GroupFoo / GroupBar / Fnord / metadata quux.h5

4. Descarregando os metadados do atributo, que é um atributo do grupo raiz no arquivo
qux.h5:
h5dump -a / metadata quux.h5

5. Produzindo uma lista XML do arquivo bobo.h5:
h5dump --xml bobo.h5> bobo.h5.xml

6. Descarregando um subconjunto do conjunto de dados / GroupFoo / databar / no arquivo quux.h5
h5dump -d / GroupFoo / databar --start = "1,1" --stride = "2,3" --count = "3,19"
--block = "1,1" quux.h5

7. O mesmo exemplo usando a forma abreviada para especificar os parâmetros de subconjunto:
h5dump -d "/ GroupFoo / databar [1,1; 2,3; 3,19; 1,1]" quux.h5

ATUAL STATUS

A versão atual do h5dump exibe as seguintes informações:
* Grupo
o atributo de grupo (ver atributo)
o membro do grupo
* Conjunto de dados
o atributo do conjunto de dados (ver atributo)
o tipo de conjunto de dados (ver tipo de dados)
o espaço do conjunto de dados (ver Dataspace)
o dados do conjunto de dados
* Atributo
o tipo de atributo (ver tipo de dados)
o espaço de atributos (ver Dataspace)
o Atribua dados
* Tipo de dados
o tipo inteiro
-H5T_STD_I8BE, H5T_STD_I8LE, H5T_STD_I16BE, ...
o tipo de ponto flutuante
-H5T_IEEE_F32BE, H5T_IEEE_F32LE, H5T_IEEE_F64BE, ...
o tipo de corda
o tipo composto
- tipo composto nomeado, não nomeado e transiente - inteiro, flutuante ou
membro do tipo string
o tipos opacos
o tipo de referência
- referências de objeto
- regiões de dados
o tipo enum
o tipos de dados de comprimento variável
- apenas tipos atômicos
- matriz escalar ou unidimensional de tipos de comprimento variável
suportado
* Espaço de dados
o espaço escalar e simples
* Ligação suave
*Link rígido
* Detecção de loop

Use o h5dump online usando os serviços onworks.net