Este é o comando insdseqget que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
insdseqget - formata sequências do GenBank como um XML INSDSet
SINOPSE
insdseqget [-] [-d nome do arquivo] [-i nome do arquivo] [-m n / p / b] [-n] [-o nome do arquivo] [-v]
DESCRIÇÃO
insdseqget recupera dados de sequência biológica do GenBank (de acordo com uma lista de entrada de
Números de acesso GI) e imprime-o como um documento XML INSDSet.
OPÇÕES
Um resumo das opções está incluído abaixo.
- Imprimir mensagem de uso
-d nome do arquivo
Insira o nome do arquivo para a lista de datas (acessos desejados, um por linha, seguido por um
linha em branco e uma lista de datas permitidas, também uma por linha)
-i nome do arquivo
Nome do arquivo de entrada para lista GI (padrão = stdin)
-m n / p / b
Tipo de molécula:
Nucleotídeo (padrão)
proteína p
b ambos
-n Retorne apenas novos registros (para os quais o GI fornecido se refere a uma versão antiga)
-o nome do arquivo
Nome do arquivo de saída para o XML INSDSet (padrão = stdout)
-v Buscar variações SNP
Use insdseqget online usando serviços onworks.net
