Este é o comando mergere que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fusão - mesclar duas sequências sobrepostas
SINOPSE
fusão -uma sequência seqüência -seqüência seqüência [-arquivo de dados matrizf] [-gapopen flutuar]
[-gapextend flutuar] -arquivo de saída alinhar -outseq sequência
fusão -Socorro
DESCRIÇÃO
fusão é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Alinhamento: Consenso".
OPÇÕES
Entrada seção
-uma sequência seqüência
-seqüência seqüência
-arquivo de dados matrizf
Este é o arquivo de matriz de pontuação usado ao comparar sequências. Por padrão, é o
arquivo 'EBLOSUM62' (para proteínas) ou o arquivo 'EDNAFULL' (para sequências nucleicas). Esses
os arquivos encontram-se no diretório 'data' da instalação do EMBOSS.
Adicional seção
-gapopen flutuar
Valor padrão: @ ($ (acdprotein)? 50.0: 50.0)
-gapextend flutuar
Valor padrão: @ ($ (acdprotein)? 5.0: 5.0)
saída seção
-arquivo de saída alinhar
-outseq sequência
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