mia-2dmyocard-icaseries - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-2dmyocard-icaseries - Execute uma análise ICA em uma série de imagens 2D

SINOPSE

mia-2dmyocard-icaseries -i [opções]

DESCRIÇÃO

mia-2dmyocard-icaseries Este programa é usado para executar um ICA em uma série de
imagens de perfusão fornecidas em um conjunto de segmentação, a fim de criar referências sintéticas que
pode ser usado para correção de movimento por registro de imagem. Se o objetivo é executar um completo
compensação de movimento, então é melhor executar mia-2dmyoica-nonrigid, uma vez que este programa é
essencialmente o mesmo sem os bits de registro.

OPÇÕES

Arquivo-IO
-i --in-file = (entrada, obrigatório); fragmento
entrada do conjunto de dados de perfusão

-r --referências = (saída); fragmento
Base do nome do arquivo para as imagens de referência. O tipo de imagem e o esquema de numeração são
retirado das imagens de entrada.

-c --save-cropped = (saída); fragmento
salvar o conjunto recortado do conjunto original neste arquivo, os arquivos de imagem usarão
o radical do nome como base do nome do arquivo

--save-feature = (saída); fragmento
salvar as imagens de características resultantes do ICA e algumas imagens intermediárias
usado para a segmentação RV-LV com o nome de arquivo fornecido com base em arquivos PNG.
Salve também os coeficientes da melhor mistura inicial e da mistura final de IC
matriz.

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

ICA
-C --components = 0
Componentes ICA 0 = estimativa automática Componentes IICA 0 = automático
estimativa

--normalizar
ICs normalizados

--sem meios
não retire a média das curvas de mistura

-s --segscale = 1.4
segmente e dimensione a caixa de corte em torno do segmento LV (0 = sem segmentação) e
dimensione a caixa de corte em torno do LV (0 = sem segmentação)

-k --skip = 0
pule imagens no início da série, pois são de outras
modalitiesskip imagens no início da série como são de outras
modalidades

-m --max-ica-iter = 400
número máximo de iterações no ICA; número máximo de iterações no ICA

-E --segmethod = features
Método de segmentação
pico delta - diferença das imagens de realce de pico
características - imagens de destaque
recurso delta - diferença das imagens de destaque

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

EXEMPLO

Avalie as referências sintéticas do conjunto segment.set e salve-as em refXXXX. ??? por
usando cinco componentes independentes e pulando 2 imagens. Por padrão, uma caixa delimitadora
em torno do LV será segmentado e dimensionado em 1.4 e as imagens cortadas serão salvas em
cropXXXX. ??? e um conjunto de segmentação cropped.set é criado. O tipo de arquivo de imagem ??? é
deduzido das imagens de entrada em segment.set.

mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2-C 5

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

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com ABSOLUTAMENTE NENHUMA GARANTIA e você pode redistribuí-lo sob os termos do GNU
LICENÇA PÚBLICA GERAL Versão 3 (ou posterior). Para obter mais informações, execute o programa com o
opção '--copyright'.

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