mia-2dseries2sets - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-2dseries2sets - Combina imagens de uma série em conjuntos.

SINOPSE

mia-2dseries2sets -o [opções]

DESCRIÇÃO

mia-2dseries2sets Este programa pega todos os arquivos de imagem que são fornecidos como parâmetros livres em
a linha de comando e cria conjuntos de segmentação com base nas informações encontradas nas imagens.
A informação usada é a localização z da fatia e o número de aquisição. O código é
taylored para usar os respectivos descritores definidos na norma DICOM. Todas as imagens com
o mesmo local de fatia será agrupado em um conjunto de segmentação e ordenado
de acordo com seu número de aquisição. As localizações das fatias são arredondadas para uma precisão de três dígitos
para tornar viável a comparação adequada dos valores de ponto flutuante.

OPÇÕES

-o --out-directory = (saída, obrigatório); fragmento
diretório de saída (precisa existir e ser gravável)

--sem cópia
não copie os arquivos de imagem para o diretório de saída

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

PLUGINS: 2dimage / io

bmp Suporte para entrada / saída de imagem BMP 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

dicom Io de imagem 2D para DICOM

Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal

exr um plugin 2dimage io para imagens OpenEXR

Extensões de arquivo reconhecidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos suportados:
32 bits sem sinal, ponto flutuante de 32 bits

jpg um plugin 2dimage io para imagens jpeg em escala de cinza

Extensões de arquivo reconhecidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal

png um plugin 2dimage io para imagens png

Extensões de arquivo reconhecidas: .PNG, .png

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

cru Suporte para saída de imagem 2D RAW

Extensões de arquivo reconhecidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

tif Suporte para entrada / saída de imagem TIFF 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal, 32 bits sem sinal

vista um plugin 2dimage io para imagens vista

Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

EXEMPLO

Crie os conjuntos de segmentação de uma série de imagens DICOM e copie os arquivos para o
diretório de saída (copiar é o padrão).

mia-2dseries2sets -o / home / user / series /net/dicoms/patient1/series1/*.dcm

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

Este software é protegido por Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemanha e Madrid, Espanha. Vêm
com ABSOLUTAMENTE NENHUMA GARANTIA e você pode redistribuí-lo sob os termos do GNU
LICENÇA PÚBLICA GERAL Versão 3 (ou posterior). Para obter mais informações, execute o programa com o
opção '--copyright'.

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