Este é o comando mia-3dsegment-ahmed que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
mia-3dsegment-ahmed - Execute uma segmentação c-means difusa de uma imagem 3D.
SINOPSE
mia-3dsegment-ahmed -i -c [opções]
DESCRIÇÃO
mia-3dsegment-ahmed Este programa implementa uma variação do papel: Mohamed N. Ahmed et.
al, "A Modified Fuzzy C-Means Algorithm for Bias Field estimation and Segmentation of MRI
Data ", IEEE Trans. On Medical Imaging, Vol. 21, No. 3, março de 2002, as alterações são: p = 2, e
exp
OPÇÕES
Arquivo-IO
-i --in-file = (entrada, obrigatório); Io
imagem a ser segmentada Para os tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io
-c --class-file = (saída, obrigatório); Io
imagens de probabilidade de classe, o tipo de imagem deve oferecer suporte a várias imagens e
valores de ponto flutuante Para os tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io
-b --out-file = (saída); Io
A imagem com correção de polarização será do mesmo tipo da imagem de entrada. Se este
parâmetro não for fornecido, a correção de polarização não será aplicada. Para
tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io
Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais
--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais
-h --ajuda
imprima esta ajuda
-? --uso
imprimir uma pequena ajuda
--versão
imprima o número da versão e saia
parâmetros
-n --no-of-classes = 3
número de classes; número de classes
-C --class-centers =
centros de classes iniciais, este parâmetro substitui 'não-de-classes'.
-s --spread = 64
parâmetro de propagação que descreve a força das distinções de mattar propagação
parâmetro que descreve a força da distinção mattar
Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).
PLUGINS: 3dimage / io
analisar Analisar imagem 7.5
Extensões de arquivo reconhecidas: .HDR, .hdr
Tipos de elementos suportados:
8 bits não assinados, 16 bits assinados, 32 bits assinados, ponto flutuante 32 bits,
ponto flutuante de 64 bits
conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno
Extensões de arquivo reconhecidas:. @
dicom Série de imagens Dicom como 3D
Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm
Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal
hdf5 IO de imagem 5D HDF3
Extensões de arquivo reconhecidas: .H5, .h5
Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, flutuante
ponto de 32 bits, ponto flutuante de 64 bits
ínria Imagem INRIA
Extensões de arquivo reconhecidas: .INR, .inr
Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits
mhd MetaIO 3D IO de imagem usando a implementação VTK (experimental).
Extensões de arquivo reconhecidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd
Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits
bacana NIFTI-1 imagem 3D IO
Extensões de arquivo reconhecidas: .NII, .nii
Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, ponto flutuante 32
bit, ponto flutuante 64 bits
vff Formato raster VFF Sun
Extensões de arquivo reconhecidas: .VFF, .vff
Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal, 16 bits com sinal
vista Visualização 3D
Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista
Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado
vti Entrada e saída VTK-XML de imagem 3D (experimental).
Extensões de arquivo reconhecidas: .VTI, .vti
Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits
vtk Entrada e saída de legado de imagem 3D VTK (experimental).
Extensões de arquivo reconhecidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado
EXEMPLO
Execute uma segmentação de 5 classes sobre a imagem de entrada input.v e armazene as imagens de probabilidade da classe
em cls.v.
mia-3dsegment-ahmed -i entrada.v -a 5 -o cls.v
AUTOR (es)
Gert Wollny
DIREITOS AUTORAIS
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opção '--copyright'.
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