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minccmp - Online na nuvem

Execute minccmp no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando minccmp que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

PROGRAMA:

NOME


minccmp - compare um ou mais arquivos minc usando operadores de comparação

SINOPSE


minccmp [ ] [ ...]

DESCRIÇÃO


minccmp irá calcular medidas estatísticas simples entre dois arquivos minc ou mais por
comparando todos os arquivos subsequentes com o primeiro. Os resultados para cada arquivo subsequente são então
devolvido em ordem. Por padrão, todas as estatísticas são calculadas. Se as estatísticas específicas forem
solicitado por meio de uma opção de linha de comando, apenas as estatísticas solicitadas são impressas.

Um recurso muito útil deste programa é a capacidade de restringir o conjunto de voxels
incluídos no cálculo estatístico, seja pela restrição da faixa de valores incluídos
(-floor, -ceil ou -range), ou usando um arquivo de máscara (-mask) com um intervalo restrito.

As estatísticas de comparação disponíveis no minccmp são fornecidas abaixo. Observe que dois destes
(-xcorr e -zscore) são uma aproximação muito próxima do que é usado no minctracc.

OPÇÕES


Observe que as opções podem ser especificadas de forma abreviada (desde que sejam exclusivas) e
pode ser fornecido em qualquer lugar na linha de comando.

Geral opções


-espancar
Substitua um arquivo existente.

-noclobber
Não substitua um arquivo existente (padrão).

-depurar Despeje muitas informações extras (para quando as coisas derem errado).

-verboso
Imprima informações extras (mais do que o padrão).

-quieto Imprima apenas os números solicitados

-max_buffer_size_in_kb tamanho
Especifique o tamanho máximo dos buffers internos (em kbytes). O padrão é 4 MB.

-check_dimensions
Verifique se todos os arquivos de entrada têm amostras correspondentes nas dimensões do mundo (padrão).

-nocheck_dimensions
Ignore quaisquer diferenças na amostragem de dimensões mundiais para arquivos de entrada.

Volume alcance opções


-chão minutos
Um limite inferior para intervalos de dados a serem incluídos nos cálculos estatísticos.

-teto max
Um limite superior para intervalos de dados a serem incluídos nos cálculos estatísticos.

-alcance minutos,max
Um limite inferior e superior para os intervalos de dados a serem incluídos nas estatísticas.

-mascarar nome do arquivo.mnc
Nome do arquivo a ser usado para mascarar dados incluídos nos cálculos estatísticos.

Basic estatística


-todos Calcule todas as medidas estatísticas. Este é o padrão.

-ssq Imprime a diferença de soma quadrada entre dois arquivos de entrada
SSQ = Soma ((AB) ^ 2)

-rmse Imprime o erro quadrático médio entre dois arquivos de entrada
RMSE = sqrt (1 / n * Soma ((AB) ^ 2))

-xcorr Imprimir a correlação cruzada entre dois arquivos de entrada
XCORR = Sum ((A * B) ^ 2) / (sqrt (Sum (A ^ 2)) * sqrt (Sum (B ^ 2))

-zscore
Imprime a diferença de pontuação z entre dois arquivos de entrada
ZSCORE = Soma (| ((A - média (A)) / stdev (A)) -
((B - média (B)) / stdev (B)) | ) / n

-semelhança
Calcule a matriz de confusão, assumindo que os valores de volume representam um
classe discreta de valores possíveis. O valor máximo do rótulo está atualmente limitado a
dez (10). Imprime a estatística de similaridade de dados, bem como especificidade, sensibilidade,
precisão e kappa para cada classe e para os volumes gerais.

Generic opções por todos os comandos:


-Socorro Imprime o resumo das opções da linha de comando e sai.

-versão
Imprima o número da versão do programa e saia.

Use minccmp online usando serviços onworks.net


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