miview - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

miview - Visualizador para arquivos de imagens médicas

SINOPSE

visão geral [ opções ]

DESCRIÇÃO

miview: Visualizador para arquivos de imagens médicas

Os formatos de arquivo são identificados automaticamente por sua extensão.

Global opções:
-explodir: Aumentar o tamanho da tela por este fator (padrão = 1)

-brilhante: Brilho relativo da tela (padrão = 0.0)

-cor: Use o mapa de cores para exibir os valores

-contraste: Contraste relativo da tela (padrão = 0.0)

-jogar fora: Despeje todas as imagens como arquivos bitmap (bmp) e saia, use o prefixo de nome de arquivo fornecido

-lenda: Exportar legenda como bitmap para este arquivo

-baixo: Limite de janela inferior: Este valor aparecerá em preto no display

-map: Carregar mapa de sobreposição (voxels coloridos sobrepostos na imagem) deste arquivo

-Legenda do mapa: Exportar legenda do mapa como bitmap para este arquivo

-maplow: Limite de janela inferior para mapa de sobreposição (padrão = 0.0)

-mapreto: Tamanho relativo dos retângulos que representam voxels do mapa de sobreposição
(padrão = 0.60)

-mapupp: Limite de janela superior para mapa de sobreposição (padrão = 0.0)

-sem escala: Desativar escala em exibição 2D / 3D

-gravando: Registre coordenadas e valores clicados neste arquivo

-upp: Limite de janela superior: Este valor aparecerá em branco no display

-val: Salve o valor de ROI / seleção de ponto neste arquivo

-v ou para depurar / rastrear todos os componentes ou um único
componente, respectivamente. Os valores possíveis para nível de log são: 0 (noLog), 1 (errorLog),
2 (warningLog), 3 (infoLog).

fMRI opções (Dar at mínimo -desenhar e -fmri para ativar):
-bonferr: Use a correção de Bonferroni

-corr: Limite de probabilidade de erro para correlação (padrão = 0.050)

-davg: Suavizar a função de design usando um filtro de média móvel de largura N (TR)
(padrão = 0)

-desenhar: Carregar o design fMRI deste arquivo (separados por vírgula ou espaço)

-fmáscara: arquivo de máscara fMRI

-fmri: Carregar dados fMRI deste arquivo

-hrf: Função de desenho de convolução pela função de resposta hemodinâmica antes da correlação (ver
Glover NeuroImagem 9, 416-429)

-vizinho: Próximos vizinhos mínimos com ativação significativa (padrão = 1)

-curso: Despejar o curso de tempo de mudança do sinal fMRI relativo para este arquivo

-smap: Mapa de despejo da mudança relativa do sinal fMRI para este arquivo

-zmap: Despejar o mapa de pontuação z para este arquivo

-zscore: limite de z-Score para correlação (padrão = 0.0)

Envie o ler opções:
-encontro: Data da verificação [aaaammdd] (padrão = 20140807yyyymmdd)

-fp: FOV na direção da fase [mm] (padrão = 220.0 mm)

-fr: FOV na direção de leitura [mm] (padrão = 220.0 mm)

-fs: FOV na direção do corte [mm] (padrão = 5.0 mm)

-nº: Número de medições consecutivas (padrão = 1)

-nx: Número de pontos na direção de leitura (padrão = 1)

-Nova Iorque: Número de pontos na direção da fase (padrão = 1)

-nz: Número de pontos na direção da fatia (padrão = 1)

-pnascimento: Data de nascimento do paciente [aaaammdd] (padrão = 00000000aaaammdd)

-pid: Identificador exclusivo do paciente (padrão = desconhecido)

-pnome: Nome completo do paciente (padrão = desconhecido)

-psex: Sexo do paciente (opções = MFO, padrão = O)

-ppeso: Peso do paciente [kg] (padrão = 50.0 kg)

-sciente: Nome do cientista (padrão = desconhecido)

-SD: Distância entre cortes (de centro a centro) [mm] (padrão = 10.0 mm)

-serd: Descrição da série (padrão = desconhecido)

-serno: Número da série (padrão = 1)

-st: Espessura da fatia [mm] (padrão = 5.0 mm)

-viga: Descrição do estudo (padrão = desconhecido)

-tcnome: Nome da bobina de transmissão (padrão = desconhecido)

-chá: Tempo para eco da sequência [ms] (padrão = 80.0 ms)

-Tempo: Hora da verificação [hhmmss] (padrão = 090951hhmmss)

-tr: Tempo entre excitações consecutivas [ms] (padrão = 1000.0ms)

-cplx: Trate os dados como complexos e extraia o componente fornecido (opções = nenhum abs pha real
imag, default = none)

-ds: Índice do conjunto de dados a ser extraído se vários conjuntos de dados forem lidos

-filtro: Leia apenas os conjuntos de dados cujo parâmetro de protocolo 'chave' contém a string
'valor' (fornecido no formato 'chave = valor')

-fmap: Para reduzir o uso de memória, mantenha o mapeamento de arquivos após ler os dados (brutos), mas gravando
na matriz resultará em uma falha

-jdx: Se vários arrays JDX estiverem presentes, selecione este

-rdialeto: Leia os dados usando um determinado dialeto do formato. (o padrão é nenhum dialeto)

-rf: Leia o formato, use-o para substituir a extensão do arquivo (opções = detecção automática 3db analise asc
coi dat dcm duplo flutuante gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, padrão = detecção automática)

-pular: Pule esta quantidade de bytes antes de ler os dados brutos (padrão = 0)

Filtros:
-alinhar : Alinhe os dados com a geometria (localizações de voxel) de
um arquivo externo

-máscara automática : Criar máscara usando limite baseado em histograma automático

-grupo : Crie clusters de voxels adjacentes / vizinhos diferentes de zero, classificados por tamanho

-convolver <kernel de convolução (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp), diâmetro do kernel [mm]>: Convolução em dimensões espaciais

- tendência <Número de componentes de baixa frequência a serem removidos, média zero do resultado
curso do tempo>: Remova o desvio lento ao longo do tempo

-editar <String de posição/intervalo no formato (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),novo valor
de voxel>: Editar valores de voxel único

-genmask : Criar máscara incluindo todos os voxels com valor
em determinado intervalo

-isotrópico : tornar isotrópico de voxels de imagem através de interpolação (imagem
geometria não mudará)

-passagem baixa : Filtragem passa-baixa

-máximo : Cortar todos os valores acima do valor máximo

-máximo : Execute a projeção de intensidade máxima
sobre a direção dada

-mesclar : Mesclar conjuntos de dados em um único conjunto de dados expandindo a dimensão do tempo

- min : Corte todos os valores abaixo do valor mínimo

-minip : Execute a projeção de intensidade mínima
sobre a direção dada

-noNaN : Substitui cada NaN pelo valor fornecido

-pflip : Inverte os dados na direção da fase

-prange : Selecione o intervalo em
direção de fase

-proj : Execute a projeção média sobre o dado
direção

-máscara de quantil : Criar máscara incluindo todos os voxels acima da fracionária fornecida
limiar

-redimensionamento : Redimensionamento temporal dos dados da imagem

-redimensionar : Redimensionamento espacial dos dados da imagem

- recortar : redimensiona a imagem para um determinado
orientação

-rflip : Inverte os dados na direção de leitura

-podridão : Rotação no plano

-organizar : Selecione o intervalo em
direção de leitura

-escala : Redimensionar valores de imagem

-slip : Inverte os dados na direção da fatia

-mudança <mudança de direção de leitura [pixel], mudança de direção de fase [pixel], mudança de direção de fatia
[pixel]>: Muda os dados espacialmente

-slictime : Correto para
diferentes pontos de aquisição de fatias

- emenda : emendas o
imagem na direção dada

-srange : Selecione o intervalo em
direção do corte

-swapdim <[rps] [-], [rps] [-], [rps] [-]>: troca / reflete dimensões especificando uma direção
triplo com sinal de reflexão opcional anexado

-telha : Combine fatias em uma imagem 2D quadrada

estranho : Selecione o intervalo em
direção do tempo

-tshift : Mudança de dados no tempo

-tipomax : Cortar todos os valores acima do máximo de um tipo de dados específico

-typemin : Corte todos os valores abaixo do mínimo de um tipo de dados específico

-usar máscara : Crie um conjunto de dados 1D incluindo todos os valores dentro da máscara do arquivo

Suportado lima extensões (formatos):
3db (dados binários Iris3D)

analisar
(NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

asc (ASCII, dialetos: tcourse)

coi (conjuntos de dados JCAMP-DX)

dat (matriz de dados 2D Matlab ascii)

dcm (DICOM, dialetos: siemens)

duplo (dados brutos duplos)

float (dados brutos flutuantes)

gz (contêiner GNU-Zip para outros formatos)

hdr (Interfile, dialetos: neurostat)

hdr (NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

idx (índices 3D de não zeros em ASCII)

ima (DICOM, dialetos: siemens)

interfil
(Interfile, dialetos: neurostat)

jdx (formato de imagem JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialetos: siemens)

mhd (MetaImagem)

nii (NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

ph (DICOM, dialetos: siemens)

png (Gráficos de Rede Portáteis)

pos (posições xy de não zeros em ASCII)

pro (protocolos de medição ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (dados brutos assinados de 16 bits)

s32bit (dados brutos assinados de 32 bits)

s8bit (dados brutos assinados de 8 bits)

smp (conjuntos de dados JCAMP-DX)

u16bit (dados brutos de 16 bits não assinados)

u32bit (dados brutos de 32 bits não assinados)

u8bit (dados brutos de 8 bits não assinados)

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