Este é o comando removeDup que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
removeDup - um componente do pacote de subreads
USO
removerDup [opções] -i -o
Argumentos necessários:
-i Nome do arquivo de entrada no formato SAM.
-o Nome do arquivo SAM de saída, incluindo leituras filtradas.
Argumentos de aptidões:
-r
Especifique o corte de duplicação. Todas as leituras mapeadas para um local são removidas de
a saída se o número de leituras mapeadas para este local for igual ou maior que
o corte. 10 por padrão.
-t Um diretório que armazena arquivos temporários gerados pelo programa.
-c
O número máximo de leituras que o arquivo de entrada pode ter. 40 milhões por padrão.
Use removeDup online usando serviços onworks.net
