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trna2sap - Online na nuvem

Execute trna2sap no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando trna2sap que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

PROGRAMA:

NOME


trna2sap - converte a saída tRNAscan-SE em um objeto ASN.1 Seq-annot

SINOPSE


trna2sap [-] [-a] [-c str] [-f str] [-i nome do arquivo] [-j] [-m str] [-n str] [-o nome do arquivo]
[-p dir] [-r dir] [-s] [-t str] [-u] [-x str]

DESCRIÇÃO


trna2sap lê um arquivo de texto produzido por tRNAscan-SE e produz um ASN.1 Seq- correspondente
anotação no formato compreendido por outras ferramentas NCBI.

OPÇÕES


Um resumo das opções está incluído abaixo.

- Imprimir mensagem de uso

-a Adicionar citação tRNAscan-SE

-c str Comentário

-f str Filtro de Substring

-i nome do arquivo
Arquivo de entrada única (entrada padrão por padrão)

-j Basta produzir uma tabela de recursos de cinco colunas, à la trna2tbl(1).

-m str Observação

-n str Nome da anotação (normalmente “tRNA”).

-o nome do arquivo
Arquivo de saída único (saída padrão por padrão)

-p dir Caminho para arquivos

-r dir Caminho para resultados

-s Ignorar pseudo tRNAs

-t str Título da anotação (normalmente “tRNAscan-SE”).

-u Ignorar tRNAs indeterminados

-x str Sufixo de seleção de arquivo com -p (.trna por padrão).

Use trna2sap online usando serviços onworks.net


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