Este é o aplicativo Linux denominado Reconstrução automática de linhagem celular, cuja versão mais recente pode ser baixada como testData.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Reconstrução automática de linhagem celular com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Reconstrução automática de linhagem celular
DESCRIÇÃO
De Amat et al., Nature Methods, 2014 *:
"A reconstrução abrangente de linhagens celulares em organismos multicelulares complexos é um objetivo central da biologia do desenvolvimento. Apresentamos uma estrutura computacional de código aberto para segmentação e rastreamento de núcleos celulares com alta precisão e velocidade. Demonstramos sua (1) generalidade, reconstruindo linhagens celulares em dados de imagem quadridimensionais de tamanho de terabyte de embriões de mosca-da-fruta, peixe-zebra e camundongo, adquiridos com três tipos diferentes de microscópios de fluorescência, (2) escalabilidade, por meio da análise de estágios avançados de desenvolvimento com até 20,000 células por ponto de tempo , a 26,000 células min-1 em uma única estação de trabalho de computador e (3) facilidade de uso, ajustando apenas dois parâmetros em todos os conjuntos de dados e fornecendo ferramentas de visualização e edição para curadoria de dados eficiente. Nossa abordagem atinge em média 97.0% de precisão de ligação em todas as espécies e modalidades de imagem. "
* Por favor, cite este artigo se você usar este código para sua pesquisa
Público
Ciência / Pesquisa, Usuários Finais / Desktop
Interface com o usuário
Console / Terminal
Linguagem de Programação
C ++, C
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/tgmm/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
