Este é o aplicativo Linux denominado BiomeNet para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como BiomeNet.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado BiomeNet para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
BiomeNet para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
A metagenômica produz um número enorme de sequências microbianas que podem ser atribuídas a uma função metabólica. O uso de tais dados para inferir a divergência metabólica no nível da comunidade é dificultado pela falta de uma estrutura estatística adequada. Aqui, descrevemos um novo modelo bayesiano hierárquico, denominado BiomeNet (inferência bayesiana de redes metabólicas), para inferir a prevalência diferencial de redes metabólicas entre comunidades microbianas. Para inferir a estrutura das interações metabólicas no nível da comunidade, o BiomeNet aplica uma estrutura de modelagem de associação mista às informações de abundância de enzimas. A ideia básica é que os componentes da mistura do modelo (reações metabólicas, sub-redes e redes) são compartilhados por todos os grupos (amostras do microbioma), mas as proporções da mistura variam de grupo para grupo. Por meio dessa estrutura, o modelo pode capturar estruturas aninhadas nos dados. O BiomeNet é único na modelagem de cada amostra de metagenoma como uma mistura de sistemas metabólicos complexos (metabossistemas).Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
C ++, S / R
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
