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Download do gerador de imagem de anel BLAST para Linux

Download grátis do aplicativo BLAST Ring Image Generator Linux para rodar online no Ubuntu online, Fedora online ou Debian online

Este é o aplicativo Linux denominado BLAST Ring Image Generator, cuja versão mais recente pode ser baixada como BRIG-0.95-dist.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.

Baixe e execute online este aplicativo chamado BLAST Ring Image Generator com OnWorks gratuitamente.

Siga estas instruções para executar este aplicativo:

- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.

- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.

- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.

- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.

- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.

- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.

SCREENSHOTS

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Gerador de imagem de anel BLAST


DESCRIÇÃO

BRIG é um aplicativo de plataforma cruzada (Windows / Mac / Unix) que pode exibir comparações circulares entre um grande número de genomas, com foco no tratamento de dados de montagem do genoma.

Por favor, cite o artigo BRIG se o BRIG for usado para gerar números para publicações: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): comparações simples do genoma procarioto, BMC Genomics, 12: 402. PMID: 21824423

Recursos

  • As imagens mostram semelhança entre uma sequência de referência central e outras sequências como anéis concêntricos.
  • O BRIG irá realizar todas as comparações BLAST e análise de arquivos automaticamente por meio de uma interface de usuário simples.
  • Limites de Contig e cobertura de leitura podem ser exibidos para genomas de rascunho; gráficos e anotações personalizados podem ser exibidos.
  • Usando um conjunto de genes definidos pelo usuário como entrada, o BRIG pode exibir a presença, ausência, truncamento ou variação de sequência de genes em um conjunto de genomas completos, genomas de rascunho ou mesmo dados de sequência não montados e brutos.
  • O BRIG também aceita arquivos de mapeamento de leitura formatados por SAM, permitindo que regiões genômicas presentes em dados de sequência não montados de várias amostras sejam comparados simultaneamente


Público

Ciência / Pesquisa



Linguagem de Programação

Java



Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/brig/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.


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