Este é o aplicativo Linux denominado CAMPARI para execução no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como campari_v3_09052017.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado CAMPARI para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CAMPARI para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
Temos o orgulho de apresentar a versão 3 do CAMPARI. Este é um grande passo em relação à versão 2, principalmente devido ao suporte abrangente de OpenMP (paralelismo de threads) e devido a melhorias significativas na usabilidade e no desempenho. Também adicionamos novamente uma série de novos algoritmos da literatura recente, e CAMPARI, é claro, continua a apoiar o paradigma de campo de força ABSINTH e o modelo de solvatação implícito.CAMPARI é um pacote conjunto para realizar e analisar simulações moleculares, em particular de polímeros de relevância biológica. Ele se concentra em uma ampla disponibilidade de algoritmos para amostragem (avançada) e é capaz de combinar a amostragem de Monte Carlo e dinâmica molecular de maneira contínua. CAMPARI oferece ao usuário um alto nível de controle sobre todos os recursos implementados. Para obter mais informações e recursos, consulte a página inicial do projeto em http://campari.sourceforge.net. A versão 2 não é mais mantida ativamente, mas a versão final continua disponível.
Recursos
- Amostragem combinada de MC e MD, MD em espaço cartesiano ou torcional / corpo rígido
- Paralelização OpenMP eficiente de todas as rotinas de energia / força principais
- Análise ou execução instantânea como uma ferramenta de análise de trajetória (também em paralelo)
- Muitas rotinas de análise integradas (DSSP, mapas de contato, funções de correlação de pares, etc.)
- Suporte para vários agrupamentos estruturais e algoritmos relacionados, juntamente com análises de modelo de estado de Markov
- Totalmente documentado (html) e, adicionalmente, enviado com 13 tutoriais
- Nível de controle muito alto (por exemplo, restrições holonômicas personalizadas em MD)
- Amplo suporte para técnicas de simulação de múltiplas réplicas paralelas, como troca de réplicas em execução paralela híbrida MPI / OpenMP
- Instalação de análise autônoma para as instalações do modelo de estado de cluster / Markov
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal
Linguagem de Programação
Fortran
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/campari/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
