Este é o aplicativo Linux denominado CSBB-v3.0, cuja versão mais recente pode ser baixada como CSBB-v3.0.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado CSBB-v3.0 com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CSBB-v3.0
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DESCRIÇÃO
O CSBB é um conjunto de bioinformática baseado em linha de comando para analisar dados biológicos adquiridos por meio de vários meios de experimentos biológicos. CSBB é implementado em Perl, enquanto também aproveita o uso de R, java, python e ruby em background para módulos específicos. O foco principal do CSBB é permitir que os usuários da comunidade de biologia e bioinformática se beneficiem da execução de tarefas de análise down-stream enquanto elimina a necessidade de escrever código de programação. CSBB está atualmente disponível em Linux, UNIX.Atualmente o CSBB oferece 18 módulos focados em tarefas analíticas, como realizar normalização de quantis superiores, visualização interativa e pipelines de sequenciamento de próxima geração. O CSBB agora também tem capacidade para processar dados públicos. Fornecendo ao usuário uma experiência de pipeline de ponta a ponta.
Recursos
- RNA-Seq
- Chip-Seq
- ATAC-Seq
- Normalização
- Expressão Diferencial
- Processamento de Dados Públicos
- Pipelines ponta a ponta
- Open Source
- Visualização
- Bioinformática
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
