Este é o aplicativo Linux denominado FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny para ser executado no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como ffp-3.19.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny para ser executado no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny para executar no Linux online
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DESCRIÇÃO
FFP (perfil de frequência de recurso) é uma ferramenta de comparação sem alinhamento para análise filogenética e comparação de texto. Pode ser aplicado a sequências de nucleotídeos, genomas completos, proteomas e até mesmo usado para comparação de texto.Recursos
- Comparação de genomas, sequências de proteínas e ácidos nucleicos no formato FASTA
- Saída de matriz de distância estilo Phylip
- Mais de uma dúzia de medidas de distância
- Usa um método de comparação rápido e livre de alinhamento
- Implementação de hashing Rabin-Karp rápido para contagem de k-mer
- A função hash de semente espaçada / mascaramento permite incompatibilidades de DNA / aminoácidos
Público
Ciência / Pesquisa, Educação
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Shell Unix, Perl, C
Ambiente de Banco de Dados
Arquivo plano
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/ffp-phylogeny/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
