Este é o aplicativo Linux chamado High-Throughput Tabular Data Processor, cuja versão mais recente pode ser baixada como htdpinstaller.exe. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online gratuitamente este aplicativo chamado High-Throughput Tabular Data Processor with OnWorks.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Processador de dados tabulares de alto rendimento
DESCRIÇÃO
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) é um aplicativo Java que se destina a facilitar a exploração de dados e tarefas de redução em grandes arquivos de texto resultantes de tecnologias de alto rendimento, por exemplo, sequenciamento massivamente paralelo ou microarrays. O software foi otimizado para microarray e dados de sequenciamento paralelo profundo, no entanto, pode aceitar qualquer conjunto de dados tabulares delimitados por caracteres. O HTDP também pode importar, processar e converter arquivos Variant Call Format (VCF) ver. 4.0, 4.1 e 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
O HTDP fornece funcionalidade de filtragem rápida e pode processar dados que consistem em um ou vários arquivos de entrada.
Citação: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Processador de dados tabulares de alto rendimento - ferramenta gráfica independente de plataforma para processar grandes conjuntos de dados. PLoS ONE 13 (2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Recursos
- funciona em quaisquer dados de coluna delimitados por caracteres (por exemplo, BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- mesclar arquivos de dados tabulares vertical e horizontalmente
- mesclar quaisquer arquivos de dados tabulares usando a localização do genoma ou coluna (s) comum (s)
- recursos ilimitados de filtragem e redução de dados
- arquivos diferentes em relação ao formato e conteúdo podem ser analisados ao mesmo tempo
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/htdp/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
