Este é o aplicativo Linux denominado HMCan, cuja versão mais recente pode ser baixada como HMCan.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado HMCan com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
HMCan
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DESCRIÇÃO
HMCan é uma ferramenta baseada no modelo oculto de Markov, desenvolvida para detectar a modificação de histonas em dados de seq de ChIP de câncer. Ele aplica três etapas de correção aos dados: correção do número de cópias, correção de polarização do GC e correção do nível de ruído.
Para executar o HMCan, é necessário o arquivo de alinhamento de destino ChIP-seq e o arquivo de alinhamento de controle. Algumas configurações também são necessárias; para obter mais informações, verifique o arquivo README.
Autor: Haitham Ashoor
Contato: Valentina Boeva Institute Curie
Universidade de Ciência e Tecnologia Haitham Ashoor King Abdullah.
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/hmcan/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.