Este é o aplicativo Linux chamado MAF, cuja versão mais recente pode ser baixada como MAF.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute on-line este aplicativo chamado MAF com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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MAF
DESCRIÇÃO
Sequências de nucleotídeos de DNA e RNA são um elemento onipresente em todas as células biológicas e servem, por um lado, como uma biblioteca abrangente de capacidades para as células e, por outro, como um sistema regulatório impressionante para controlar a função celular. A estrutura de alinhamento múltiplo (MAF) apresentada deve fornecer aos pesquisadores uma plataforma simples de alinhamento de sequências como um modelo funcional, flexível o suficiente para ajustar todas as etapas, mas também abrangente o suficiente para combinar muitas ferramentas diferentes e combinações de parâmetros personalizados, caso uma análise aprofundada seja necessária ou recomendada em situações de baixa taxa de leitura, por exemplo. A plataforma permite que os pesquisadores apliquem múltiplos alinhadores de sequência e outras ferramentas de pré e pós-processamento em combinações flexíveis para analisar as diferenças, que vão de sutis a notáveis, entre diferentes algoritmos de alinhamento e processamento de sequências aplicados à mesma base de dados.
Cite a seguinte publicação: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Recursos
- Aplicação conjunta de diferentes ferramentas de alinhamento exemplificadas por scripts bash
- Etapas flexíveis de pré e pós-processamento, extensíveis e completamente redesenhadas
- Modelos Bash que economizam tempo de desenvolvimento
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil em um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
