Este é o aplicativo Linux denominado Molecular Dynamics Studio, cuja versão mais recente pode ser baixada como WindowsRelease.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Molecular Dynamics Studio com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Estúdio de Dinâmica Molecular
DESCRIÇÃO
Esta é uma coleção de modificações de software criadas para integrar NanoEngineer-1, PACKMOL e MSI2LMP com o objetivo de criar facilmente células de dinâmica molecular. O NanoEngineer-1 é um software CAD molecular desenvolvido pela Nanorex e fornece ao usuário uma maneira fácil de criar moléculas, enquanto as modificações do software permitem que o usuário digite átomos usando vários campos de força. O PACKMOL pode gerar uma coleção aleatória de moléculas usando os modelos de moléculas do NanoEngineer-1, fornecendo assim a célula MD inicial. As modificações no PACKMOL permitem que os dados do tipo de átomo sejam passados para o software MSI2LMP. MSI2LMP cria um arquivo de entrada LAMMPS baseado em campos de força classe I ou classe II. MSI2LMP foi modificado para usar dados de campo de força codificados numericamente gerados pelo NanoEngineer-1. O formato de arquivo MMP foi estendido e integrado em todos os três aplicativos de software.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Funcionalidades
- Capacidade de CAD molecular via NanoEngineer-1
- Digite átomos manualmente com base no campo de força atômica CFF91
- Crie modelos de moléculas usando NanoEngineer-1
- Gerar uma célula MD usando PACKMOL e modelos de moléculas múltiplas
- Gerar um arquivo de entrada de geometria LAMMPS usando MSI2LMP
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
OpenGL, Qt
Linguagem de Programação
Fortran, Python, C ++, C
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
