Este é o aplicativo Linux denominado ParDRe, cuja versão mais recente pode ser baixada como ParDRe-rel2.2.5.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ParDRe com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
ParDRe
Ad
DESCRIÇÃO
ParDRe é uma ferramenta paralela para remover leituras duplicadas. As leituras duplicadas podem ser vistas como idênticas
ou sequências quase idênticas com algumas incompatibilidades. Esta ferramenta permitirá aos usuários evitar a análise de leituras desnecessárias, reduzindo o tempo de procedimentos subsequentes com o conjunto de dados (por exemplo, montagens, mapeamentos, etc.).
A ferramenta é implementada com MPI para explorar as capacidades paralelas de múltiplos núcleos
clusters. É mais rápido do que as contrapartes multithread (final de 2015) para o mesmo número de núcleos e, graças à tecnologia de passagem de mensagens, pode ser executado em clusters.
Também existe uma contraparte MapReduce de ParDRe, chamada MarDRe (consulte o link acima).
ATUALIZAÇÃO: A partir da versão 2.0.5, ParDRe também oferece suporte para remover apenas duplicatas ópticas (e deixar duplicatas biologicamente interessantes), bem como para trabalhar com entrada / saída compactada no formato .gz.
Público
Tecnologia da Informação, Indústria de Saúde, Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal, linha de comando
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/pardre/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
