Este é o aplicativo Linux chamado RNAseqR, cuja versão mais recente pode ser baixada como RNAseqR_1.1.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado RNAseqR com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
Ad
RNAseqR
DESCRIÇÃO
RNAseqR é projetado para análise de expressão de dados de RNA-seq e é mais adequado para análise de bibliotecas múltiplas não replicadas. É um programa codificado em C ++ atualmente compilado para sistemas Linux.
Com GUI e interfaces de linha de comando, ele pode fazer transformações de log, PPM e / ou RPKM (se os comprimentos forem fornecidos), bem como análise estatística para expressão diferencial, usando a função de distribuição cumulativa binomial negativa (CDF) ou a estatística de teste R introduzido para análise de EST por Stekel, et al.
A saída permite decisões baseadas em probabilidades de CDF, principais valores de R ou comparação de valores de R com dados aleatórios. As comparações são a métrica de credibilidade de Stekel et al, ou observado vs R esperado em uma dada expressão média. A randomização é por meio de Poisson ou distribuições binomiais negativas, ou embaralhamento de colunas.
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
