Este é o aplicativo Linux chamado SASHIMI cuja versão mais recente pode ser baixada como TPP_Setup_6.3.3.exe. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SASHIMI com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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SASHIMIA
DESCRIÇÃO
O projeto Sashimi hospeda o Trans-Proteomic Pipeline (TPP), um conjunto maduro de ferramentas para proteômica baseada em especificação de massa (MS, MS/MS): validação estatística, quantificação, visualização e conversores de dados brutos de MS para o mzML aberto/ formatos mzXML.
Recursos
- Mecanismos de pesquisa de banco de dados (cometa etc.)
- SpecraST (mecanismo de pesquisa da biblioteca Spectrum)
- Pesquisa em massa aberta (Magnum etc.)
- Kojak (pesquisa de reticulação)
- Análise DDA
- DISCo (Análise DIA)
- reSpect (Análise de Espectro Quimérico)
- Quantificação de MS1 e MS2 marcada e não marcada
- Geração de Banco de Dados Decoy
- PeptideProphet (validação de nível PSM)
- iProphet (validação de nível de peptídeo)
- PTMProphet (validação de modificação pós-tradução)
- Validação do Nível de Proteína
- Geração da Biblioteca de Espectro
- Ferramentas de visualização de dados
- Catalogação e previsão do tempo de retenção
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Baseado na Web, linha de comando
Linguagem de Programação
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/sashimi/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
