Este é o aplicativo Linux chamado Seqshell, cuja versão mais recente pode ser baixada como start.jar. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Seqshell com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Seqshell
DESCRIÇÃO
Combina as funções Tophat e Cuffdiff em uma interface GUI. A touca e o punho devem ser pré-instalados no sistema.
Ao modificar o programa, ele pode ser usado para executar qualquer programa de linha de comando, mesmo pacotes R, uma vez que R também pode ser executado a partir de linhas de comando.
Novas funções:
Função de processamento em lote para Tophat. Agora você pode executar quantos trabalhos de mapeamento quiser com o tophat. Este programa salvará a saída em pastas separadas.
Um e-mail de alerta será enviado para o seu endereço de e-mail quando o trabalho for concluído. (Você precisará modificar o código-fonte para alterar o conteúdo para atender às suas necessidades especiais)
As informações de tempo de execução serão exibidas em uma janela de saída JAVA.
Público
Desenvolvedores, usuários finais / desktop
Interface com o usuário
Java swing
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/seqshell/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
