Este é o aplicativo Linux chamado SplitMEM, cuja versão mais recente pode ser baixada como splitmem.1.0.tgz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SplitMEM com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
Dividir MEM
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DESCRIÇÃO
Com o surgimento de tecnologias de sequenciamento aprimoradas, a genômica está se expandindo de um paradigma de referência única por espécie para uma abordagem pan-genômica mais abrangente com vários indivíduos representados e analisados juntos. Aqui, apresentamos um novo algoritmo de tempo e espaço O (n log n) chamado splitMEM, que constrói diretamente o gráfico de Bruijn compactado para um pan-genoma de comprimento total n. Para atingir essa complexidade de tempo, aumentamos a árvore de sufixo com saltos de sufixo, uma nova construção que nos permite percorrer vários links de sufixo em tempo constante e usá-los para decompor eficientemente as correspondências exatas máximas (MEMs) durante uma travessia da árvore de sufixo.
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/splitmem/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.