Este é o aplicativo Linux denominado SW #, cuja versão mais recente pode ser baixada como swsharp-src.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SW # with OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SW #
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DESCRIÇÃO
SW # (swsharp) é uma biblioteca para alinhamento de sequência baseada em GPUs habilitadas para CUDA. Ele utiliza o algoritmo de Hirschbergs e Ukkonens para eficiência de memória e velocidade adicional. A biblioteca é escalonável para uso com várias GPUs. Algumas partes da biblioteca utilizam MPI para clusters habilitados para CUDA.Este trabalho foi apoiado em parte pela Croatian Science Foundation no âmbito do projeto UIP-11-2013-7353.
Pesquisa de banco de dados agora disponível!
Publicações:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
Trabalho relatado:
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
NOVO:
SW # edição web:
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/swsharp/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
