Este é o aplicativo Linux denominado SWAPHI-LS: Alinhamento no cluster Xeon Phi para ser executado no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SWAPHI-LS: Alinhamento em Xeon Phi Cluster para executar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SWAPHI-LS: Alinhamento no cluster Xeon Phi para executar no Linux online
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DESCRIÇÃO
O primeiro algoritmo paralelo Smith-Waterman que explora clusters Intel Xeon Phi para acelerar o alinhamento de longas sequências de DNA. Este algoritmo é escrito em C ++ (com um conjunto de extensões intrínsecas SIMD), OpenMP e MPI. A avaliação de desempenho revelou que nosso algoritmo atinge um desempenho muito estável e produz um desempenho de até 30.1 GCUPS em um único Xeon Phi e até 111.4 GCUPS em quatro Xeon Phis compartilhando um host.Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal, linha de comando
Linguagem de Programação
C + +
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
