Este é o aplicativo Linux chamado VIGOR3 para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como VIGOR3.tgz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado VIGOR3 para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
Ad
VIGOR3 para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
VIGOR é uma ferramenta para anotar genes codificadores em genomas virais. Foi desenvolvido por Jeffrey Hoover e Shiliang Wang para o Centro de Sequenciamento Genômico JCVI para Doenças Infecciosas (GSCID).http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
entre em contato com:
Jeff Hoover
301-540-7858
[email protected]
Recursos
- compreende edição de RNA, deslizamento ribossômico, códon de parada lido-thru e códons de início alternativo
- anota peptídeos maduros em poliproteínas
- lida com genes emendados, sobrepostos e incorporados
- lida com genomas circulares, parciais e de rascunho (com lacunas)
- diagnostica frameshifts na montagem
- inclui conjuntos de dados de referência para mais de 50 espécies
- inclui ferramentas para criar novos conjuntos de dados de referência
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Perl
Ambiente de Banco de Dados
SQLite
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
