Este é o aplicativo do Windows chamado BLAST Ring Image Generator, cuja versão mais recente pode ser baixada como BRIG-0.95-dist.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado BLAST Ring Image Generator com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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Gerador de imagem de anel BLAST
DESCRIÇÃO
BRIG é um aplicativo de plataforma cruzada (Windows / Mac / Unix) que pode exibir comparações circulares entre um grande número de genomas, com foco no tratamento de dados de montagem do genoma.Por favor, cite o artigo BRIG se o BRIG for usado para gerar números para publicações: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): comparações simples do genoma procarioto, BMC Genomics, 12: 402. PMID: 21824423
Recursos
- As imagens mostram semelhança entre uma sequência de referência central e outras sequências como anéis concêntricos.
- O BRIG irá realizar todas as comparações BLAST e análise de arquivos automaticamente por meio de uma interface de usuário simples.
- Limites de Contig e cobertura de leitura podem ser exibidos para genomas de rascunho; gráficos e anotações personalizados podem ser exibidos.
- Usando um conjunto de genes definidos pelo usuário como entrada, o BRIG pode exibir a presença, ausência, truncamento ou variação de sequência de genes em um conjunto de genomas completos, genomas de rascunho ou mesmo dados de sequência não montados e brutos.
- O BRIG também aceita arquivos de mapeamento de leitura formatados por SAM, permitindo que regiões genômicas presentes em dados de sequência não montados de várias amostras sejam comparados simultaneamente
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/brig/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
