Este é o aplicativo do Windows denominado FastQC, cuja versão mais recente pode ser baixada como v0.12.1sourcecode.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado FastQC com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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FastQC
DESCRIÇÃO
FastQC é uma ferramenta de análise de controle de qualidade projetada para detectar possíveis problemas em conjuntos de dados de sequenciamento de alto rendimento. Seu objetivo é fornecer uma maneira simples de verificar a qualidade dos dados de sequência bruta provenientes de pipelines de sequenciamento de alto rendimento. Ele faz isso executando um conjunto modular de análises em um ou mais arquivos de sequência bruta no formato fastq ou bam. Em seguida, ele produz um relatório resumindo os resultados e destacando quaisquer áreas em que a biblioteca possa parecer incomum. Isso deve direcioná-lo para onde seus dados podem ter problemas e permitir que você tome as medidas necessárias para corrigi-lo antes de fazer qualquer análise adicional.
O FastQC não está vinculado a nenhum tipo específico de técnica de sequenciamento, portanto, pode ser usado para examinar bibliotecas de vários tipos de experimentos (sequenciamento genômico, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq etc, etc.).
Funcionalidades
- Importa dados de arquivos BAM, SAM ou FastQ
- Oferece uma visão geral rápida que destaca possíveis áreas problemáticas
- Gráficos e tabelas de resumo para avaliação rápida dos dados
- Exportar resultados para HTML
- Pode ser usado offline
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
