Este é o aplicativo do Windows chamado Gen3D, cuja versão mais recente pode ser baixada como gen3d.cpp. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Gen3D com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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Gen3D
DESCRIÇÃO
Gen3D é um aplicativo desenvolvido para determinar modelos tridimensionais de genoma e cromossomo. Ele usa dados de contato cromossômicos para construir conformações tridimensionais. Este método pode gerar modelos cromossômicos tridimensionais que satisfazem uma grande parte dos contatos cromossômicos.
O software é desenvolvido no Laboratório de Bioinformática, Mineração de Dados e Aprendizado de Máquina do Prof. Jianlin Cheng no Departamento de Ciência da Computação da Universidade de Missouri - Columbia, EUA. O projeto é apoiado pela National Science Foundation (bolsa no. DBI1149224).
Se você usa Gen3D em sua pesquisa, cite:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao e Jianlin Cheng. "Reconstrução iterativa de modelos tridimensionais de cromossomos humanos a partir de dados de contato cromossômicos." BMC bioinformática 16, no. 1 (2015): 338.
Funcionalidades
- Use dados de contato cromossômicos adquiridos usando a técnica Hi-C
- Construir genoma estrutural 3D e modelos cromossômicos a partir de dados de contato cromossômicos
- Inicialize as coordenadas usando abordagem probabilística
- Novo método para representar contatos satisfeitos na matriz de mapa de calor
- Esquemas de pontuação para descobrir contatos de longo e curto alcance
- Comparado com outro método existente e também validado com características do genoma
Público
Ciência / Pesquisa, Engenharia
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/gen3d/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
