Este é o aplicativo do Windows chamado Javamony para ser executado no Windows online sobre o Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como Javamony.jar. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Javamony para rodar no Windows online sobre Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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Javamony para rodar no Windows online sobre Linux online
DESCRIÇÃO
Baseado no não tão bem sucedido Pysimony (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), o mesmo aluno determinado dá outra chance ao problema filogenético.Javamony é invocado da seguinte forma:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [random / stepwise (iniciar árvore)] [# de bootstraps] [outgroup taxon # 1] [outgroup taxon # 2] ...
Não pretendendo ser um programa competitivo de inferência filogenética, Javamony é uma oportunidade para eu adquirir a linguagem Java enquanto aprendo a abordar e resolver problemas fundamentais em filogenética. Portanto, para meu próprio benefício educacional, todo código é original. Claro, provavelmente também há muitos erros.
Eu distribuo Javamony, como fiz Pysimony, esperando que seja de valor educacional para outra pessoa ou, pelo menos, vagamente divertido.
Os próximos recursos serão:
- Suporte para sequências de aminoácidos
- Suporte para formatos de arquivo adicionais (por exemplo, Nexus)
- Multithreading
- Métodos de pontuação adicionais (por exemplo, probabilidade máxima)
Recursos
- Usa parcimônia máxima
- Lê um arquivo de entrada FASTA (apenas DNA)
- Grupo externo estabelecido pelo usuário
- Árvores iniciais de adição aleatória e gradual
- Usa SPR (poda de subárvore e reenquadramento) pesquisa de árvore
- Executa bootstrapping
- Formato de saída Newick padrão com suporte de bootstrap e ramais
- Desenha a árvore final com suporte para bootstrap
Público
Ciência / Pesquisa, Educação
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/javamony/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
