Este é o aplicativo do Windows chamado MCPerm: Monte Carlo SNP permutation para executar no Windows online sobre Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como MCPerm_1.1.2.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MCPerm: Monte Carlo SNP permutation para executar no Windows online sobre Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
MCPerm: permutação SNP de Monte Carlo para executar no Windows online sobre Linux online
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DESCRIÇÃO
MCPerm: Um método de permutação de Monte Carlo para correlação de teste múltiplo em estudo de associação caso-controleO teste de permutação tradicional (TradPerm) é um método de análise não paramétrica importante que pode ser tratado como o padrão ouro para várias correções de teste em estudo de associação de caso-controle. No entanto, ele se baseia nos dados de genótipos e fenótipos de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) original para realizar um grande número de embaralhamentos aleatórios e, portanto, é computacionalmente intensivo, especialmente para estudo de associação de todo o genoma (GWAS). Para melhorar a velocidade de cálculo sem alterar o tamanho do valor p do TradPerm, desenvolvemos um método de permutação de Monte Carlo (MCPerm) como uma alternativa eficiente ao TradPerm.
Métodos: MCPerm não precisa embaralhar os dados de genótipos e fenótipos originais. Ele usa o método de Monte Carlo, emprega distribuição hipergeométrica em duas etapas para gerar o número aleatório de genótipos (AA, Aa e aa) em casos e controles.
Linguagem de Programação
B / R
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.