Este é o aplicativo do Windows chamado Pysimony, cuja versão mais recente pode ser baixada como Pysimony.py. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Pysimony com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
Pisimonia
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DESCRIÇÃO
ATUALIZAÇÃO: após algumas correções de bug, troquei o Pysimony pelo Javamony: https://sourceforge.net/projects/javamony/
Dada a beleza de Python, sei que um dia terei que terminar Pysimony.
A primeira tentativa de um aluno em um programa de inferência filogenética, escrito no simplista, mas elegante Python.
Pysimony lê um arquivo FASTA (somente ATGC aceito) especificado como seu único argumento. Testes básicos mostraram que ele é lento, impreciso e definitivamente ineficiente. Uma árvore improvável-para-ser-a-mais-parcimoniosa é impressa após a conclusão no formato de árvore Newick básico.
Como todas as partes do programa são trabalho original de um programador iniciante, isso pode representar uma das piores abordagens para resolver o problema filogenético. Evitei claramente a programação orientada a objetos.
No entanto, distribuo esta imaginação que algum dia pode ser ligeiramente educacional ou, pelo menos, rir da tentativa patética que faz de reinventar a roda
Recursos
- Calculadora de parcimônia falha
- Lê arquivos FASTA (apenas ATGC)
- Árvore de saídas em formato Newick
- Modo simples, único
Público
Ciência / Pesquisa, Educação
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Python
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
